La iglesia de Juan Climacus, construida en 1572 con fondos de los hijos de Iván el Terrible, los príncipes Iván y Fiódor, tiene un altar principal y un lateral, consagrados en honor a los santos Juan Climacus y Fiódor Estratilata. El templo se destaca por su apariencia exterior y su ornamentación elaborada. La forma cúbica del edificio, dividida por pilastras en tres partes, se culmina con semicúpulas. En el siglo XVIII se añadió un techo a cuatro aguas, que ocultó dos niveles de kokoshniks, que anteriormente servían como transición al tambor luminoso de la cúpula. El desplazamiento del tambor hacia el lado oriental le da a la composición una ligera asimetría, que se acentuaba anteriormente con la pequeña cúpula en la esquina sureste. Esta doble cúpula es rara en la arquitectura antigua rusa, aunque es bastante común en Kirillov y Ferapontovo. La entrada a la iglesia se encuentra en el lado occidental a través de un pórtico cubierto, conectado al piso inferior por una escalera en la pared sur. Originalmente, el pórtico tenía aberturas arqueadas abiertas, que luego fueron reemplazadas por ventanas, pero las pilastras de la arcada se han conservado. Hacia el pórtico conduce un hermoso portal con columnas, decoradas con melones y un remate en forma de quilla.

El interior de la iglesia también es único. Las bóvedas de caja con arcos, que sostienen el tambor de la cúpula, descansan sobre cuatro columnas. Las columnas orientales son tradicionales, de forma cuadrada, unidas por una pared que separa el altar, mientras que las occidentales son redondas, decoradas como columnas con bases y capiteles. Los arranques de las bóvedas están marcados por cornisas-impostas. La parte occidental de la nave central está cubierta con bóvedas de crucería, lo que es un ejemplo de 'italianismos', introducidos en Rusia por arquitectos extranjeros durante el reinado de Iván III y Vasili III. La ábside de la iglesia es baja y rectangular, característica de las iglesias de puerta y de refectorio del siglo XVI, con nichos-arcossolios y un banco de piedra a lo largo de las paredes. En la esquina sureste se encuentra el altar de Fiódor Estratilata con una parte altar rectangular y un iconostasio de cuatro niveles, en el que se han conservado íconos de los siglos XVI-XVII. Dos íconos, que no entraron en los marcos, están ubicados en las paredes. Destacan especialmente las puertas reales de los siglos XVI-XVII con tallados en forma de patrón trenzado, que reflejan el arte popular del norte.