El templo, dedicado al santo Alexis, metropolitano de Moscú, fue construido en 1914 y se convirtió en parte de la iglesia de la Ascensión del Señor en el pueblo de Zimovye, en el distrito de Cherepanovo. En la década de 1930, los clérigos sufrieron represalias, y el templo se utilizó como club, casa de pioneros y más tarde, como Casa de Creatividad Infantil, donde el escenario estaba en el lugar del altar, hasta que el edificio pasó a ser propiedad de la diócesis de Novosibirsk.

En la década de 1990, los habitantes de Cherepanovo solicitaron repetidamente a la administración del distrito la devolución del edificio del templo, pero sin éxito. Solo el 30 de marzo de 2006, los diputados del distrito de Cherepanovo tomaron la decisión de transferir el edificio a la diócesis. La restauración del templo fue llevada a cabo por el igumen Kirill Skakal'skiy y la comunidad del monasterio en honor a Todos los Santos que brillaron en la tierra siberiana, con el apoyo de la administración del distrito. La primera Divina Liturgia se celebró en la Navidad de Cristo en 2008, y desde entonces los servicios religiosos se han vuelto regulares.

En otoño de 2008, la administración transfirió a la diócesis la parte adyacente del edificio de la Casa de Creatividad Infantil, con un área de 440 metros cuadrados, que necesitaba reparaciones. Posteriormente, allí se instalaron la sala de comidas, biblioteca, contabilidad, escuela dominical, club juvenil, taller de carpintería y garaje.

En mayo de 2010, se instaló un ícono mosaico del Salvador en la fachada del templo. En abril de 2011, con la bendición del arzobispo Tikhon, comenzó la construcción del campanario, que se completó en verano gracias a los esfuerzos de la comunidad del monasterio. El 5 de abril de 2012, el obispo de Iskitim y Cherepanovo, Luka, bendijo las campanas, y el 8 de abril se celebró la primera liturgia arciprestal bajo su dirección.

El 21 de mayo de 2012, al templo del santo Alexis en Cherepanovo se le otorgó el estatus de catedral por resolución del Santo Patriarca de Moscú y de toda Rusia, Kiril.

Desde junio de 2014, con la bendición del obispo Luka, los estudiantes de la sección de iconografía del Instituto Teológico de Novosibirsk, San Macario, comenzaron a pintar el templo. El 17 de octubre de 2014 se celebró la conmemoración solemne del centenario del templo del santo Alexis.