Das Valaam-Kloster ist berühmt für sein einzigartiges System von Skiten, die auf der Insel inmitten malerischer Natur liegen und durch ihre Schönheit beeindrucken. Im Gegensatz zu anderen vorrevolutionären Klöstern entstanden auf Valaam bereits früh die ersten Steinskiten mit ihren Tempeln. Der erste von ihnen, der Skit zu Ehren aller Heiligen, wurde in den Jahren 1789 und 1796 unter der Leitung des bekannten Abtes Nazarius erbaut. In der Mitte des 19. Jahrhunderts wurde er von dem herausragenden russischen Architekten Alexei Gornostajev umgebaut und hat in dieser Form bis heute überdauert, obwohl er nach dem Kommen der sowjetischen Macht repariert werden musste.

Der zweite Steinskit wurde der Nikolai-Skit, der sich auf der Kreuzinsel am Eingang zur Klosterbucht befindet. Er vereint zwei Kirchen, die fast gleichzeitig von den Architekten Alexei Gornostajev und Grigori Karpow errichtet wurden. Der Skit umfasst auch einen vorrevolutionären Zellenbau für die Brüder. Interessant ist, dass die Kirche des Heiligen Nikolaus des Wundertäters neben ihren geistlichen Funktionen als Leuchtturm für vorbeifahrende Schiffe diente.

Die Preobraschenski- und die Konevski-Skite, die 1858 und 1870 erbaut wurden, sind ebenfalls von Interesse, haben jedoch aufgrund der antireligiösen Kampagne der sowjetischen Zeit nicht bis heute überlebt. Besonders schwer wiegt der Verlust der Glocke, die dem Kloster zu Zeiten von Boris Godunow geschenkt wurde und sich im zweiten Stock der Kirche des Preobraschenski-Skits befand. Die Bolschewiki zerstörten weitere sechs Skite, von denen einige wiederhergestellt wurden, aber die genauen Daten ihrer Wiederherstellung sind unbekannt.

Neben den Skiten auf Valaam hatte das Kloster Skite auf den Inseln Putsari, des Heiligen Hermann und Vossinansaari. Diese wurden ebenfalls in der sowjetischen Zeit zerstört, und derzeit finden auf den ersten beiden Inseln Restaurierungsarbeiten statt. Glücklicherweise hat das Kloster dennoch einen Teil seiner einzigartigen Skite bewahrt.