Die Dreifaltigkeitsbasilika, die sich an der Westseite des Kremls befindet, ist eine Durchgangsbasis und hat eine abzweigende Schießscharte. Sie wurde zwischen 1495 und 1499 vom Architekten Alawis Frazin erbaut und vervollständigte die Befestigungen an der Seite des Neglinnaja-Flusses, heute Alexandrowski Garten. Im Jahr 1516 wurde von der Basilika aus eine steinerne Dreifaltigkeitsbrücke über den Fluss errichtet, hinter der der Kutafja-Turm entstand. Im 16. und 17. Jahrhundert waren die Dreifaltigkeitstoren nach den Spasski-Toren die zweitwichtigsten und ermöglichten den Zugang zum Kreml zu den Residenzen des Patriarchen, der Zarin und der Prinzessinnen.

Am Ende des 17. Jahrhunderts wurde der Turm mit einem hohen Dach aufgestockt und erhielt eine architektonische Dekoration, die der der Spasski-Basilika ähnelt, sowie Uhren, die nach dem Brand von 1812 nicht wiederhergestellt wurden. Zwischen 1870 und 1895, als das Archiv des Ministeriums des kaiserlichen Hofes in den Turm verlegt wurde, wurde er umgebaut und viele alte Elemente gingen verloren. Im 19. Jahrhundert, nachdem der Neglinnaja-Fluss in ein Rohr geleitet wurde, wurde die weiße Rampe zum Kutafja-Turm durch eine Ziegelrampe ersetzt. Im Jahr 1901 wurde eine neue Dreifaltigkeitsbrücke gebaut.

Der Turm hat sechs Etagen und tiefe zweigeschossige Keller, die zur Verteidigung genutzt wurden und im 16. und 17. Jahrhundert als Gefängnis dienten. Alle Etagen sind durch ein Treppensystem am Umfang des Turms verbunden. Im zweiten Geschoss der Schießscharte befindet sich ein Raum mit einer flachen Decke. Der Turm wird von einem kleinen viereckigen Teil gekrönt, über dem ein achteckiger Teil mit einem offenen Beobachtungsbereich und einem hohen Dach emporragt. Dekorative Türmchen und Pinnacles an den Ecken der Brüstungen sowie spitzbogige Bögen bilden die Grundlage für die reiche Dekoration. Früher sah der Turm noch festlicher aus dank der Verzierungen an der Schießscharte.

Die Höhe des Turms bis zum Stern von der Kremlseite beträgt 65,65 m, mit dem Stern 69,3 m. Von der Seite des Alexandrowski Gartens erreicht die Höhe des Turms 76,35 m, mit dem Stern 80 m.