Die Eisenbahn von Moskau nach dem Dorf Sawjolowo an der Wolga wurde auf Initiative von Sawwa Mamontow, dem Vorsitzenden des Vorstands der Moskauer-Jaroslawler-Arkhangelsker Eisenbahn, gebaut. Geplant war eine Verlängerung bis Uglich, Kaljasin und Rybinsk, um den Flusshandel auf der Wolga mit Moskau zu verbinden. Mamontow, zusammen mit dem Finanzminister S.Ju. Witte, wusste, dass die Linie in den ersten Jahren keinen Gewinn abwerfen würde, hielt sie jedoch für strategisch wichtig für die Entwicklung der nördlichen Regionen Russlands.

Der Bau begann von der Station Losinoostrowskaja der Moskauer-Jaroslawler-Arkhangelsker Eisenbahn bis zur Station Beskudnikowo, von wo aus die Sawjolowskaja Straße begann.

Der Bahnhof wurde am Stadtrand von Moskau, bei der Butyrka-Zollstelle, wo das Land günstig war, errichtet. Der Abschluss der Bauarbeiten war für den Winter 1899 geplant, aber die Arbeiten wurden unerwartet gestoppt. Die Moskauer-Windauer Eisenbahn bot an, das Grundstück Beskudnikowo, Sawjolowo zu kaufen und den Bahnhof an einem anderen Ort zu bauen. Im Sommer 1900 wurde jedoch die Moskauer-Jaroslawler-Arkhangelsker Eisenbahn vom Staat aufgekauft, der Deal fand nicht statt, und der Bau des Bahnhofs wurde am alten Standort fortgesetzt.

Die Arbeiten wurden von Ingenieur A.S. Sumarokow geleitet, der möglicherweise der Autor des Bahnhofsprojekts war. Das Bahnhofsgebäude war einstöckig, mit einem zweigeschossigen zentralen Teil. Der Bau wurde 1902 abgeschlossen. Zuvor fuhren die Züge vom Jaroslawler Bahnhof ab und wechselten über die Verbindungsstrecke Beskudnikowo, Losinoostrowskaja zur Sawjolowskaja Eisenbahn. Die Eröffnung des Zugverkehrs vom neuen Bahnhof, der Butyrski genannt wurde, fand am 10. (23.) März 1902 statt. Der Bahnhof wurde der neueste in Moskau.

Im Jahr 1900 erkannte die Moskauer Stadtversammlung die Bedeutung des Bahnhofs und erwartete einen Anstieg der Preise für angrenzende Grundstücke, weshalb sie die Grenzen Moskaus und des Moskauer Kreises änderte und den Bahnhof in die Stadtgrenzen einbezog.

Der Savelovsky Bahnhof galt immer als der ruhigste, und die Sawjolowskaja Richtung als die am wenigsten frequentierte. Ilf und Petrow erwähnen in „Die zwölf Stühle“, dass die geringste Anzahl von Menschen über den Savelovsky Bahnhof nach Moskau kommt: Schuhmacher aus Taldom, Einwohner von Dmitrow, Arbeiter der Jachrom-Manufaktur und Datschenbesitzer aus Chlebnikowo. Die Fahrt nach Moskau auf dieser Linie dauert nicht lange, die maximale Entfernung beträgt einhundertdreißig Werst.

Im Laufe der Zeit wurde der Bahnhof für den steigenden Passagierstrom zu klein. Von hier aus konnte man nach Rybinsk, Uglich und St. Petersburg (über Sonkowo) fahren, aber die Reise nach Petersburg dauerte aufgrund der wenig befahrenen eingleisigen Strecken einen Tag. 1987 begann die Rekonstruktion des Savelovsky Bahnhofs, nach der er zweigeschossig wurde, dabei jedoch sein Erscheinungsbild bewahrte. Im Jahr 1999 wurden alle Fernzüge zum Belorussischen Bahnhof verlegt, und die Schließung des Savelovsky wurde diskutiert.

Heute ist der Savelovsky Bahnhof der einzige in Moskau, der nur Vorortzüge bedient. In den Jahren 2004 und 2010 bediente er Expresszüge zum Flughafen Scheremetjewo.