Der Glockenturm wurde zu Beginn des 20. Jahrhunderts auf einem Grundstück errichtet, das von der Stadt erworben wurde. Im März 1906 wandte sich die Äbtissin Zinaida an den astrachanischen Bischof Georgij Orlow mit der Bitte, den Bau eines neuen Glockenturms nach dem gewählten Projekt zu genehmigen. Die vorläufigen Kostenschätzungen für Materialien und Arbeiten beliefen sich auf 20.000 Rubel, von denen 15.000 vom Kloster bereitgestellt wurden, während die verbleibenden 5.000 durch Spenden gesammelt werden sollten. Der Bau wurde genehmigt, und im Frühjahr 1905 begannen die Arbeiten. Bis September 1907 war der Glockenturm fertiggestellt, jedoch war die endgültige Kosten deutlich höher als erwartet. Dies geschah dank großzügiger Spenden, insbesondere von dem bekannten astrachanischen Kaufmann S.V. Noskov, was es ermöglichte, den Bauumfang zu erweitern. Mit dem Kommen der Sowjetmacht wurde das Kloster geschlossen und der Glockenturm 1930 abgerissen.

Im Jahr 2010 begann die zweite Phase der Wiederherstellung des Blagoweschtschenski Klosters, die die Rekonstruktion des Glockenturms umfasste. Die Arbeiten dauerten drei Jahre und kosteten mehr als 250 Millionen Rubel, die vom Ministerium für Kultur Russlands im Rahmen des Programms „Kultur Russlands“ bereitgestellt wurden. Das Fundament und die Ziegelmauer des ersten Geschosses wurden wiederhergestellt, und die zweiten und dritten Geschosse wurden rekonstruiert. Der Glockenturm wurde nach alten Zeichnungen und Fotografien neu gebaut, mit einer genauen Nachbildung aller Muster und dekorativen Elemente. Im Dezember 2012 fand die Weihe und die Installation des Kreuzes statt, was den Abschluss der Arbeiten markierte. Die Wiederherstellung der verlorenen Glockenstube war für 2013 geplant.

Der Glockenturm ist im eleganten alt-russischen Stil gestaltet und hat drei Geschosse über den heiligen Toren, die von Westen in das Kloster führen. Seine Höhe übersteigt 60 Meter. An der Basis des Glockenturms befindet sich ein Rechteck der heiligen Tore, gefolgt von dem ersten massiven sechseckigen Geschoss mit sechs kleinen rechteckigen Fenstern unten und sechs runden oben. Die zweite und dritte Geschosse sind filigraner, mit sechs großen Fenstern für das Geläut. Den Glockenturm krönt eine Kuppel mit einem vergoldeten Apfel und einem achtzackigen Kreuz. An der Basis der Kuppel ist in goldenen Buchstaben die Inschrift: „Gesegnet sei der Kommende im Namen des Herrn“ angebracht. Über dem Eingang zum Kloster wurde ebenfalls eine halbrunde Inschrift rekonstruiert: „Freue dich, Begnadete, der Herr ist mit dir“. Früher wog die größte Glocke der verlorenen Glockenstube etwa 7 Tonnen und hatte einen kraftvollen Klang. Auf ihrem oberen Teil stand die Inschrift: „Verkündet der Erde große Freude“, und auf dem unteren: „Im Reich von Kaiser Nikolai Alexandrowitsch errichtet im Frauenkloster Blagoweschtschenski in Astrachan unter der Äbtissin Zinaida, der Aufseherin Stefania und der Nonne Platonida.“