Die Planung des Morozov-Kinderkrankenhauses basierte auf dem Pavillonprinzip, das nach der Untersuchung europäischer Erfahrungen ähnlicher Einrichtungen gewählt wurde. Für verschiedene Patientenkategorien wurden separate isolierte Gebäude je nach Art der Erkrankung errichtet, um Kreuzinfektionen zu verhindern. Diese Entscheidung wurde von einer speziellen ärztlichen Kommission getroffen, zu der der Chefarzt des St. Wladimir-Krankenhauses S. Vasilievsky, der Chefarzt des Sokolnitscheski-Krankenhauses V. Schnaubert und der Chefarzt des geplanten Morozov-Krankenhauses N. Alexeev gehörten. Der Architekt I. A. Ivanov-Shitz arbeitete an der Planung des Geländes und der Anordnung der Gebäude gemäß diesem Programm.

Das Herzstück des Krankenhausgebäudes war ein geräumiger Gemeinschaftsraum, an den kleinere Zimmer anschlossen.

Das Gebäude für die Diphtherie-Abteilung wurde 1902 erbaut und im Januar 1903 als eine der ersten Abteilungen des Morozov-Krankenhauses eröffnet. Es war für 40 Patienten ausgelegt und umfasste 2 Pavillons mit je 14 Betten, 2 Dampfräume mit je 2 Betten, 2 Zimmer mit je 3 Betten, 1 Zimmer mit 2 Betten, einen Operationssaal, ein Labor, 2 Buffets, 2 Toiletten und 2 Aufenthaltsräume für Kinder. Die Planung und Ausstattung des Gebäudes waren ähnlich wie die des „Scharlachgebäudes“ des Krankenhauses. Bei Bedarf konnte das Gebäude in zwei separate Abteilungen mit eigenen Eingängen unterteilt werden, um die Ausbreitung von Infektionen zu verhindern.

Ursprünglich war das Gebäude einstöckig, mit einem zweiten Stock nur im linken Teil, wo sich die Haupt- und Nebeneingänge befanden. Die asymmetrische Komposition verlieh dem Gebäude Dynamik. Der Mittelpunkt des rechten, einstöckigen Teils wurde durch einen Risalit mit einem großen Fenster hervorgehoben, das breiter war als die anderen. Alle Fenster waren mit modernen „Sandriken“ geschmückt und hoben sich von den unbeschichteten Ziegelwänden ab. Das Gebäude stand auf einem niedrigen Sockel mit vertieften Fenstern.

Im Jahr 1950 wurde der einstöckige Teil des Gebäudes um ein zweites Stockwerk aufgestockt. In der Sowjetzeit wurden Anbauten an das Gebäude hinzugefügt, was die ursprüngliche Komposition des Körpers veränderte. Dennoch blieb der Hauptkern des Gebäudes gut erhalten.