Etwa im Jahr 1282 wurde an der Stelle der heutigen Auferstehungskirche auf Anordnung des ersten Moskauer Fürsten Daniel Alexandrowitsch ein Kloster zu Ehren des heiligen Daniel des Säulenheiligen gegründet. Im Jahr 1330 wurde die Abtei an einen neuen Ort verlegt: Fürst Ivan Kalita beschloss, sie in den Kreml, zur Kirche des Erlösers auf der Boru, zu verlegen, um ein Kloster in der Nähe seines Palastes zu schaffen. Später wird Ivan III. dieses Kloster nach Krutitsy verlegen, wo das Neuspasski-Kloster entstehen wird. Der alte Standort des Danilov-Klosters verfiel und blieb lange Zeit verlassen. Unter Zar Ivan dem Schrecklichen wurde das Kloster 1560 wiederhergestellt, jedoch nördlicher als der frühere Standort, auf der anderen Seite des Grabens, wo sich heute das Danilov-Kloster befindet.

An dem alten Ort blieb ein Friedhof mit einer kleinen Holzkirche erhalten, die 1699 mit Steinen auf Kosten von Fjodor Vasiljew umgebaut wurde. Die Widmung zu Ehren des Daniel des Säulenheiligen verschwand, und der Hauptaltar erhielt den Namen der Auferstehung des Wortes, mit drei Seitenaltären: dem Petrus- und Paulusaltar, dem Nikolausaltar und dem Iljinsaltar. Die heutige Kirche wurde in den Jahren 1834-1837 auf Kosten von Ivan Nazarjewitsch Rybnikov, dem Eigentümer der Danilov-Manufaktur, erbaut. Sein Empire-Anwesen am Ufer der Moskwa ist teilweise erhalten geblieben und wurde zu Beginn der 2010er Jahre restauriert.

Die Kirche der Auferstehung des Wortes, entworfen von dem Architekten F.M. Shestakov, ist im Stil des späten Empire ausgeführt: Der massive Würfel des Haupttempels ist mit sechs ionischen Säulenportiken mit Giebeln geschmückt und wird von einer Kuppel mit einer Lichtrotunde gekrönt. Auf der Westseite befinden sich eine große Speisehalle und ein dreigeschossiger Glockenturm über dem Haupteingang. Neben den drei Altären der alten Kirche wurde in der Speisehalle ein vierter Altar zu Ehren des Johannes Chrysostomus hinzugefügt. Im Südwesten der Kirche blieb ein kleines einstöckiges Pfarrhaus erhalten.

Nach der Revolution funktionierte die Auferstehungskirche weiter, und hierher zogen die Mönche des Danilov-Klosters, die in Freiheit geblieben waren. Doch im Jahr 1932 wurden die Gottesdienste eingestellt. Das Gebäude wurde von verschiedenen Produktionsstätten genutzt, darunter dem Moskauer Verband zur Herstellung von Regenschirmen. Die Innenräume der Kirche wurden vollständig zerstört, und von außen gingen die Kuppeln mit Kreuzen verloren. Formell 1983 zusammen mit dem Danilov-Kloster an die Gläubigen übergeben, wurde die Auferstehungskirche erst 1989 wieder aktiv. Nach einer langen Restaurierung, die 1998 abgeschlossen wurde, erhielt die Kirche ihr historisches Erscheinungsbild zurück: Die Abschlüsse wurden wiederhergestellt, spätere Trennwände und Decken abgerissen, die Malereien und der Empire-Ikonostase wurden rekonstruiert.