Laut Überlieferung wurde das Erzbischöfliche Haus an der Stelle des ehemaligen Fürstenpalastes errichtet. Im Jahr 1522 wurde der Rjasaner Bischof Jona, der nach Rjasan berufen wurde, von der Kirche Boris und Gleb, die zuvor als Kathedrale diente, in die Uspenski-Kathedrale versetzt, die heute als Weihnachtskathedrale bekannt ist. Er war der erste, der das Fundament für das Erzbischöfliche Haus legte. In der Liste des Hundertgramm-Dokuments wird erwähnt, dass sich in der Stadt Pereslawl der Hof des Bischofs befand, auf dem sich die steinerne Kirche der Enthauptung des Johannes des Täufers befand. Bischof Jona baute zwei steinerne Kammern mit Brotunterkünften und zwei steinerne Küchen. Im Jahr 1553 berichtete Bischof Kassian den Schreibern, dass sein Hof klein sei und es keinen Platz zur Erweiterung gebe. Die Schreiber fügten seinem Hof Land des Großfürsten hinzu und nahmen im Gegenzug das Land des Bischofs. Im Jahr 1563 wandte sich Bischof Filofej ebenfalls an die Schreiber mit der Bitte um Erweiterung, und ihm wurde Land hinter dem Pferdestall zugewiesen. Im Jahr 1597 stellte der Rjasaner Schreiber Tretjak Grigorjewitsch Weljaminow dem Erzbischof Mitrophan eine Ausfertigung für einen leeren Platz für den Hof zur Verfügung. Bis Ende des 16. Jahrhunderts gab es auf dem Gelände des Erzbischöflichen Hauses verschiedene Gebäude, darunter steinerne Kirchen und Ställe. Doch am 3. September 1647 zerstörte ein Feuer die Stadt Pereslawl, einschließlich des Hofes des Erzbischofs Moisey. Das neue Erzbischöfliche Haus begann Erzbischof Misail im Jahr 1651 zu bauen. Aus Dokumenten geht hervor, dass er in den Jahren 1653-1655 steinerne Kammern sowie die Kirche der Enthauptung des Johannes des Täufers errichtete. Der Auftragnehmer war der Moskauer Meister Jurij Karniljew, Sohn von Jarschow. In den Jahren 1652-1653 fanden am Bauort Gebete mit der Weihe von heiligem Wasser statt.