Die Gründung des Dorfes Polowinskoje geht auf den Beginn des 19. Jahrhunderts zurück. Ursprünglich entstand am Ufer des Polowinnoje-Sees eine Ansiedlung mit demselben Namen, gegründet von dem staatlichen Bauern Jegor Dmitrijewitsch Petuchow, der 1805 aus dem Dorf Wwedenskoje im Ujesd Kurgan hierher zog. Bis 1812 siedelten auf Anordnung der Tobolsker Kammer auch andere Bauern aus der Wwedenski-Wolost hierher um. Eine Zeit lang blieb die Siedlung offiziell eine Ansiedlung, wurde jedoch in den Dokumenten der 1820er Jahre bereits als Dorf Polowinnoje erwähnt. Zu Beginn der 1830er Jahre entstanden rund um den Polowinnoje-See Parzellen für Umsiedler aus den zentralen Gouvernements Russlands. Die ersten Umsiedler begannen Ende der 1830er und Anfang der 1840er Jahre zu kommen, und die Ansiedlung verwandelte sich zusammen mit den Umsiedlerparzellen in eine bedeutende Siedlung, die zunächst als Dorf bezeichnet wurde und mit dem Bau der Kirche zum Dorf Polowinskoje wurde.

Es gibt eine Legende über den Namen des Dorfes, wonach es hier einen Rastplatz für Handelskarawanen gab, der sich auf halbem Weg von den kasachischen Steppen nach Kurgan befand. Dies ist jedoch unwahrscheinlich, da die Entfernung nach Kurgan deutlich größer ist als die zur befestigten Linie von Presnogorjkovskaja. Wahrscheinlicher ist, dass die Ansiedlung ihren Namen vom Polowinnoje-See erhielt, dessen Herkunft unbekannt ist.

Verwaltungstechnisch gehörte das Dorf Polowinnoje in den 1860er Jahren zur Wolost Niedne-Alabugski im Ujesd Kurgan, wurde 1881 Teil der Baschkirischen Wolost und 1905 wurde die separate Polowinskoje-Wolost gegründet. Mit dem Bau der Dreifaltigkeitskirche begann im Dorf die jährliche Feier zu Pfingsten. In den 1860er Jahren existierte sie bereits, und Ende des 19. Jahrhunderts wurde der Andrejmarkt gegründet, der jährlich vom 23. bis 30. November neben der Kirche stattfand. Zunächst gehörten die Dorfbewohner zur Gemeinde der Nikolaikirche, später zur Gottesmutter-Kasaner Kirche der Festung Presnogorjkovskaja sowie zur Heilig-Dreifaltigkeitskirche der Festung Kabanskaja. In der Mitte der 1840er Jahre trat ein Teil der Einwohner vorübergehend der Gemeinde der Nikolaikirche des Dorfes Niedne-Alabugski bei.

Im Jahr 1845 wurde die eigenständige Polowinskoje-Gemeinde gegründet, die die Dörfer Chlupowa und Chaschevitaja Filippowa umfasste, später kam das Dorf Maraj hinzu. Bis 1866 entstand in der Gemeinde das Dorf Dubrowka, ab 1869 das Dorf Baschkirskaja, ab 1871 das Dorf Schilina, ab 1884 die Dörfer Wassiljewka und Novo-Chlupowa. Im Jahr 1899 wurde das Dorf Maraj der Gemeinde der Pokrowski-Kirche des Dorfes Baidarskoje zugeordnet. Ab 1902 gingen die Dörfer Baschkirskaja und Novo-Chlupowa an die neue Gemeinde der Znamenskaja-Kirche des Dorfes Baschkirskaja über. Im Jahr 1909 wurde das Dorf Chuloshnoje der Gemeinde zugeordnet. Im Jahr 1915 wurde das Dorf Wassiljewka zu einer eigenständigen Gemeinde der Gottesmutter-Kasaner Kirche. Im Jahr 1919 wurde das Dorf Filippowa einer eigenständigen Gemeinde des Pokrowski-Gebetsraums zugeordnet, während das Dorf Chuloshnoje eine separate Gemeinde des Dimitrijewski-Gebetsraums bildete. Im Jahr 1925 bestand die Gemeinde aus dem Dorf Polowinskoje, den Dörfern Chlupowskaja und Dubrowskaja sowie den Siedlungen Novo-Ukrajinskoje, Trubetskoye und Petrowskoje und existierte in dieser Form wahrscheinlich bis zur Schließung zu Beginn der 1930er Jahre.

Bis Ende der 1830er Jahre hatte sich die Bevölkerung der Dörfer Polowinnoje, Chlupowo und Filippowo durch Umsiedler aus Zentralrussland erheblich erhöht. In diesem Zusammenhang wandten sich die Gemeindemitglieder 1839 an die Tobolsker Geistliche Konsistenz mit der Bitte um Erlaubnis zum Bau einer Kirche im Dorf Polowinnoje. Der Bau wurde genehmigt, und im selben Jahr wurde Land zugewiesen. 1844 beschlossen die Bewohner der Barabinski-Gemeinde, ihre alte Holzkirche an die Bewohner des Dorfes Polowinnoje zu verkaufen. Der Bau wurde von den Gemeindemitgliedern durchgeführt und war hauptsächlich bis 1848 abgeschlossen. Die Kirche war aus Holz, einstöckig mit einem Glockenturm. Bis 1849 war die Kirche verkleidet und gestrichen, und in den Jahren 1849-1850 wurde der Ikonostase installiert. Der Altar war im Namen der Heiligen Dreifaltigkeit.

Zu Beginn des Jahres 1852 war die Kirche bereit zur Weihe, benötigte jedoch aufgrund des instabilen Fundaments Reparaturen. Wahrscheinlich wurde der Tempel bald geweiht. 1873 baten die Gemeindemitglieder um Erlaubnis zur Reparatur des Daches und des Glockenturms, was genehmigt wurde, aber die Arbeiten wurden nicht rechtzeitig ausgeführt. 1876 begann der Umbau der Kirche, der 1877 abgeschlossen wurde. Die Kirche wurde nach dem alten Plan mit einem neuen Steinfundament und einem Zinkdach umgebaut. In der Folge wurde der Tempel weiterhin verschönert. 1882 wurde der Ikonostase erneuert, und 1886 wurde eine Kirchenumfriedung gebaut.

Die Dreifaltigkeitskirche im Dorf Polowinskoje wurde 1935 geschlossen und in ein Kulturhaus umgewandelt. Zu Beginn der 1960er Jahre wurde das Gebäude vollständig umgebaut. In den 1970er Jahren brannte das Gebäude nieder. Zu Beginn des 20. Jahrhunderts begann die Holzkirche erneut zu verfallen, und die Gemeindemitglieder beschlossen, einen neuen Steintempel zu bauen. Im Jahr 1919 wurden Vorbereitungen für den Bau getroffen, aber die Arbeiten wurden nicht abgeschlossen, und der Ziegel wurde von den Behörden beschlagnahmt. Derzeit wird ein neuer Tempel gebaut.