Die Kirche des Heiligen Alexius wurde gleichzeitig mit den Heiligen Toren des Uspenski-Klosters im Zeitraum von 1709 bis 1714 erbaut und 1720 geweiht. Um den Bau abzuschließen, waren die Äbtissin und die Nonnen gezwungen, Spenden von Gläubigen in Moskau und anderen Städten zu sammeln. Die Kirche wurde aus Stein erbaut, sie ist kalt, einstöckig, mit einer Kuppel und einem Altar. Ursprünglich war geplant, zwei Altäre zu weihen: einen zu Ehren des Heiligen Nikolaus von Myra und den anderen zu Ehren Alexius, des Menschen Gottes. Die Übertor-Kirche des Klosters hatte zwei Durchgänge, eine Seitentür und die früheren Heiligen Tore. Das Untergeschoss, das zuvor in die Umfriedung des Klosters einbezogen war, diente als Unterbau der Kirche. An den glatten Wänden des ersten Stocks wurde ein zweiter Stock errichtet, der mit Halbsäulen und Rahmen mit barocken Giebeln geschmückt war. Der obere Stock beherbergte den eigentlichen Tempel mit vier Fenstern an der Fassade, die dem Gebäude einen Wohncharakter verliehen. Die Kirche wurde von einer Kuppel im klassischen Stil gekrönt. Im Inneren der Kirche befand sich ein antikes Bild des Nikołai von Wologda mit Darstellungen vieler Heiliger, und der zweigeschossige Ikonostase, der gleichzeitig mit der Kirche geschaffen wurde, war mit goldener Schnitzerei auf blauem Hintergrund verziert.

Derzeit befindet sich die Alexius-Übertor-Kirche in einem halbzerstörten Zustand. Nach dem Verlust der Kuppel hat sie alle äußeren Merkmale eines Kultgebäudes verloren und erinnert nun an ein gewöhnliches Wohngebäude.