In Moskau gab es lange Zeit Gemeindefriedhöfe: jede Kirche hatte ihren eigenen kleinen Friedhof zur Beisetzung der ansässigen Bevölkerung. Seit der Zeit von Peter I. gab es Versuche, Beisetzungen innerhalb der Stadtgrenzen zu verbieten, aber echte Veränderungen begannen erst unter der Kaiserin Elisabeth. Im Rahmen der schrittweisen Abschaffung der Gemeindefriedhöfe (die endgültig nach der Pestepidemie in Moskau von 1770-1771 nicht mehr genutzt wurden) wurde ein spezieller Friedhof für die unprivilegierten Klassen, also für die Armen, eingerichtet. Er befand sich in der Nähe des Marjina Hains und wurde 1750 als erster städtischer Friedhof eröffnet. Neben ihm wurde eine Friedhofskirche für die Beerdigung und das Gedenken der Verstorbenen erbaut, ein kleiner Holztempel zu Ehren des heiligen Lazarus, nach dem der Friedhof den Namen Lazarusfriedhof erhielt.

Im Laufe der Zeit wurde die Holzkirche baufällig, und 1782 erhielt der Präsident des Moskauer Magistrats, Titularrat Luka Ivanovich Dolgov, die Erlaubnis, auf eigene Kosten eine steinerne Kirche mit drei Altären und ein Waisenhaus zu bauen. Nach seinem Tod 1783 übernahm seine Witwe Susanna Filippowna die Verantwortung für den Bau und vollendete die Arbeiten 1787. Luka Ivanovich wurde innerhalb der Kirche beigesetzt, sein marmorner Grabstein in Form von Engeln blieb bis ins 20. Jahrhundert erhalten. Interessant ist, dass sein Bruder Afanasy Ivanovich Dolgov ebenfalls ein Kirchenbauer wurde und die Kirche der Ikone der Gottesmutter „Freude aller Trauernden“ auf der Bolshaya Ordynka umbaute.

Der Hauptaltar der Kirche wurde zu Ehren der Herabkunft des Heiligen Geistes geweiht, während die Seitenaltäre zu Ehren des heiligen Lazarus und des heiligen Apostels Lukas, dem Schutzpatron von Luka Dolgov, geweiht wurden. Der Architekt der Kirche war Elizvoy Nazarov, es gibt jedoch die Version, dass das Projekt von Vasily Bazhenov stammt, der mit der Tochter von Dolgov verheiratet war. Die Innenräume wurden von Meistern ihrer Zeit geschmückt: Die Malereien wurden vom Italiener Antonio Claudio ausgeführt, während die Ikonen von Giovanni Scotti geschaffen wurden. Die Kirche ist als runde Rotunde mit zwei Fensterreihen gestaltet und wird von einer runden Laterne mit einer Kuppel und einem Kreuz gekrönt. Der ursprünglich kurze Speisesaal endet mit einem vier Säulen umfassenden Portikus mit zwei Glockentürmen, was die Kirche einzigartig für die orthodoxe Architektur macht.

Zu Beginn des 20. Jahrhunderts benötigte die Kirche eine Erweiterung. Nach dem Entwurf des Architekten S.F. Voskresensky wurde zwischen 1902 und 1904 der Speisesaal mehr als verdoppelt, die Seitenfassaden erhielten pilasterartige Portiken. Die westliche Eingangsstruktur wurde abgerissen und an einem neuen Ort wiederhergestellt, wobei die allgemeinen Merkmale der Kirche beibehalten, aber ihre Proportionen verändert wurden.

Seit 1914 diente der Protopriester Nikolai Alexejewitsch Skvortsov in der Kirche, ein bekannter Priester und Professor an der Moskauer Geistlichen Akademie. In der Nacht vom 14. auf den 15. Juni 1917 wurde er zusammen mit seiner Frau in seinem eigenen Haus bei der Kirche ermordet, das Ziel der Mörder waren die von ihm gesammelten Mittel für ein Kinderheim. Das Archiv von Pater Nikolai ist erhalten geblieben und befindet sich in der Russischen Nationalbibliothek.

Im Jahr 1932 wurde die Kirche geschlossen, und ihr letzter Leiter, Protopriester Ioann Smirnov, wurde erschossen. Das Gebäude wurde als Wohnheim und Werkstätten des Operetten-Theaters genutzt. 1934 begann die Zerstörung des Lazarusfriedhofs, an seiner Stelle wurde der Park „Festival“ angelegt. Das äußere Erscheinungsbild der Kirche hat sich kaum verändert, aber die Innenräume wurden zerstört und der Raum in zwei Etagen unterteilt. 1991 begann der Prozess der Rückgabe der Kirche an die Gläubigen, der nach einigen Jahren abgeschlossen wurde. Im Jahr 2000 wurde neben der Kirche eine Kapelle zu Ehren der auf dem ehemaligen Friedhof Beigesetzten geweiht.