Der Tempel zu Ehren des heiligen Makarius von Gelbwasser befindet sich nördlich der Dreifaltigkeitskathedrale, an der Stelle des ehemaligen Seitenaltars der Kathedrale, der in seinem Namen geweiht wurde. Der Bau wurde in den Jahren 1808-1809 durchgeführt, in einer Zeit, als das Kloster noch blühte. Damals konnte kaum jemand ahnen, dass das Kloster weniger als zehn Jahre später mit der Verlagerung des Marktes von Makaryev nach Nischni Nowgorod in den Niedergang geraten würde.

Die Makaryev-Kirche wurde für eine lange und wohlhabende Zukunft entworfen. Sie ist im klassischen Stil mit Elementen „hauptstädtischer“ Eleganz ausgeführt. Besonders auffällig ist die Kolonnade des toskanischen Ordens, die den Tempel mit der Dreifaltigkeitskathedrale verbindet. Die Fassaden der Kirche von der West- und Nordseite sind mit vier Säulen-Porzellan geschmückt, und der Hauptkörper endet mit einer breiten Trommel und einer mächtigen Kuppel. Ende der 1920er Jahre wurde der Tempel von der neuen Macht geschlossen, kurz nach der Schließung des Klosters im Jahr 1927. Von August 1943 bis zum 23. November 1988 wurde das Gebäude vom Lyskow Veterinärtechnikum gemietet.

Erst 1992 wurde das Gebäude der Kirche, wie auch andere Kirchen der Abtei, der Russisch-Orthodoxen Kirche übergeben. Die Restaurierung und Wiederherstellung der Fresken wurde 2005-2006 vom Wladimir Künstler und Ikonenmaler Wladimir Iwanowitsch Nekrasow durchgeführt. Anfang August 2008 besuchte der Präsident der Russischen Föderation Dmitri Medwedew das Makariev Gelbwasser Frauenkloster. Während seines Besuchs besichtigte er das Kloster, besuchte die Makaryev-Kirche und die Dreifaltigkeitskathedrale und verehrte die Reliquien des heiligen Makarius von Gelbwasser und Unzhen.