Die Kirche wurde auf dem städtischen Friedhof dank der Finanzierung eines der größten Unternehmer der Olonetz-Region Ende des 19. und Anfang des 20. Jahrhunderts, des Kaufmanns erster Gilde aus Pudozh, Nikolai Alexandrowitsch Basegskij, errichtet.

Die Grundsteinlegung fand am 7. Mai 1902 statt. Der Bau wurde aus Ziegeln errichtet, die in einer kleinen Fabrik hergestellt wurden, die N.A. Basegskij gehörte. Anfang 1903 wurden die Arbeiten abgeschlossen und die Kirche geweiht. Das Gebäude ist im russischen Stil gehalten, der für Provinzstädte zu Beginn des 20. Jahrhunderts charakteristisch ist. Die Kirche hat einen rechteckigen Hauptteil mit Vorhalle und einen schmaleren dreiseitigen Altar. Das Dach der Kirche ist mit fünf zwiebelförmigen Kuppeln auf hohen achteckigen Tambouren geschmückt.

Im Jahr 1906 wurde neben der Kirche ein steinerner vierstöckiger Glockenturm erbaut und geweiht, ebenfalls mit Mitteln von N.A. Basegskij. Die drei unteren Stockwerke sind quadratisch, das obere, offene Glockenstock, achteckig. Der Glockenturm wurde mit einer großen zwiebelförmigen Kuppel abgeschlossen. Die Fassaden der Kirche und des Glockenturms sind im russischen Stil gestaltet. Der Kirchenkomplex wurde zu einem wichtigen Element der Stadtplanung im historischen Teil von Pudozh. Für den Bau der Kirche erhielt N.A. Basegskij den Orden der Heiligen Anna 3. Klasse, und für den Glockenturm den Orden der Heiligen Anna 2. Klasse.

Anfang der 1930er Jahre wurde die Alexander-Newski-Kirche geschlossen und als Werkstätten und Lager der Pudozh MTS genutzt, und 1939 als Haus der Verteidigung. Während des Großen Vaterländischen Krieges gab es hier eine Bäckerei, später ein Lager für „Zagotzerna“. Anfang der 1960er Jahre wurde das Gebäude zu einer Molkerei. In diesem Zusammenhang wurden die Kuppeln von der Kirche und dem Glockenturm entfernt, die obere Etage des Glockenturms abgerissen, mehrere Fenster zugemauert und zusätzliche Räume angebaut, die die unteren Etagen des Glockenturms und die Fassaden der Kirche verdeckten. Die Innenräume wurden durch die Ausstattung der Molkerei stark verändert, und die Kirche verlor ihre architektonische Bedeutung.

Anfang der 2000er Jahre wurde der Kirchenkomplex an die Russische Orthodoxe Kirche übergeben, und es begann die Wiederherstellung für das Paterhaus des Muromski-Klosters. Aufgrund zahlreicher Umbauten waren erhebliche Restaurierungsarbeiten erforderlich. Heute wurden durch die Gemeinde auf dem Kirchenteil eine Kuppel installiert, Fenster und Türen ersetzt, die innere Gestaltung wird abgeschlossen, Chöre und Ikonostase installiert, der Glockenturm wird restauriert und Ingenieurnetze werden verlegt. Im Übergang zwischen der Kirche und dem Glockenturm wird der Raum für die Abendschule renoviert. Obwohl die Arbeiten noch nicht abgeschlossen sind, funktioniert die Kirche bereits und es finden Gottesdienste statt. Die Alexander-Newski-Kirche ist erneut zum orthodoxen Zentrum der alten Stadt Pudozh geworden.