Долгое время музей не мог обеспечить охрану и безопасность ценных экспонатов, поэтому найденные во время археологических раскопок артефакты передавались на хранение в банк. В 2005 году в Керченском историко-культурном заповеднике была создана Золотая кладовая. Драгоценности переместили в специально оборудованное помещение в здании музея и разместили в стеклянных витринах, защищенных сигнализацией.

В Золотой кладовой можно увидеть украшения, которые носили модницы первых веков нашей эры, узнать, что изображали на пантикапейских и боспорских монетах, и какие ценности жители античного Боспора и средневековой Керчи откладывали на «черный день».

Посетители получают уникальную возможность разгадать тайны боспорских кладов, которые занимают центральное место в нумизматическом разделе выставки.

Среди экспонатов, уникальный клад электровых монет, кизикинов, чеканенных в малоазийском городе Кизике. Здесь же представлены золотые и серебряные монеты местной боспорской чеканки, включая монеты с изображением грифона, ставшего символом современной Керчи, а также монеты великих правителей, таких как Александр Македонский и Митридат VI Евпатор.

Экспозиция включает наборы ювелирных украшений начала нашей эры: серьги, ожерелья, браслеты, амулетницы, пряжки. С древних времен ювелирные изделия использовались не только как украшения, но и как обереги и талисманы. Эту роль выполняли резные камни-геммы. В экспозиции можно увидеть часть коллекции гемм, которые ценились как дорогие украшения и использовались в качестве печатей.

Ежегодно коллекция изделий из драгоценных металлов пополняется новыми экспонатами, найденными, в том числе, и в ходе подводных археологических исследований.