Это место играет значительную роль в истории высшего образования в России и часто называется колыбелью учености. Монастырь Спаса Нерукотворного был основан Борисом Годуновым в 1600 году, а первое его упоминание в документах датируется 1635 годом. Название "Заиконоспасский" связано с его расположением за иконным рядом на Никольской улице, где иконы обменивали по установленной "божеской" цене. Существует мнение, что ранее Заиконоспасский был частью Никольского монастыря. Главный собор, посвященный иконе Спаса Нерукотворного Образа, был заложен в 1660 году при царе Алексее Михайловиче на средства князя Федора Федоровича Волконского. В 1701 году собор был перестроен Иваном Зарудным в стиле петровского барокко. В 1842-1848 годах при архимандрите Порфирии была построена колокольня над святыми воротами.

С середины XVII века монастырь стал называться "учительным". В 1665 году при царе Алексее Михайловиче Симеон Полоцкий открыл здесь первую Спасскую школу. Он и его ученик Сильвестр Медведев разработали проект создания академии, первого высшего учебного заведения для всех сословий. Официально Славяно-Греко-Латинская академия открылась в 1687 году, когда сюда перевели школу братьев Лихудов. Преподавателями были монахи Заиконоспасского монастыря, а настоятель был ректором академии. В академии изучали богословие, свободные науки, западные языки, медицину и физику. В XVIII веке здесь было 9 классов, а обучение велось на богослужебных книгах. Ученики были из разных сословий, включая князей и детей простых людей. Среди выпускников, А.Д. Кантемир, В.К. Тредиаковский, Л.Ф. Магницкий, Д.Н. Бантыш-Каменский, М.В. Ломоносов и другие.

После открытия Московского Университета в 1755 году академия стала высшей богословской школой. В 1839 году Московская Духовная семинария переехала в новое здание на Божедомке, а в 1918 году, в Сергиев Посад.

Напротив ворот находится старейший братский корпус, два нижних этажа которого построены в 1686 году, а третий этаж добавлен в 1886 году архитектором В.Д. Шером. Левее, двухэтажный корпус 1720 года архитектора Зарудного. Слева, трехэтажное здание начала XVIII века, где проходили публичные диспуты. Оно пострадало в пожаре 1812 года и было восстановлено в 1821 году.

На месте нынешнего перехода к метро находился монастырский сад с театром, где студенты ставили пьесы. Монастырь был отгорожен от улицы корпусами с лавками, которые в конце XIX века заменили здания в "русском стиле". Левый дом, построенный в 1895-1897 годах по проекту М. Преображенского, а правый с колокольней, в 1899-1900 годах архитектором З.И. Ивановым. До 1917 года здесь находился книжный магазин И.Д. Сытина.

В июле 1929 года монастырь закрыли, крест сняли, а в киоте вместо иконы Спаса Нерукотворного сделали окно. В доме №7 разместилась первая советская телестудия "Радиопередача". В 1991 году здесь открылась радиостанция Эхо Москвы.

Собор Спаса Нерукотворного был возвращен Церкви в 1992 году и стал Патриаршим подворьем. В 2011 году восстановили колокольню.