Строительство Усадебного дома началось в 1794 году после разрушительного пожара, произошедшего годом ранее. На очищенной от пожара земле в Стрелецкой слободе, между улицами Буяновой (Поморской) и Смирной (Театральный переулок), купцы Семен Болотный и Михаил Чернышев возводят каменные двухэтажные дома. Эти здания имели общий главный фасад, разделенный брандмауэром, и отличались не только фасадами, но и уровнем перекрытий. В 1894 году у домов появился новый владелец, Павла Михайловна Шингарева, которая начала их объединение в единое строение. Свой нынешний облик здание приобрело в начале XX века, когда его владелицей стала Екатерина Кирилловна Плотникова.

В начале 1920-х годов здание было национализировано у купцов Шингаревых-Плотниковых и передано советским учреждениям. В нем разместился Октябрьский райисполком города Архангельска.

В 1994 году здание передали Архангельскому музею изобразительных искусств, который с этого времени занимается его восстановлением и музеефикацией как архитектурного памятника XVIII века, «Усадебного дома Е. К. Плотниковой».

В 2000 году в еще не отреставрированном доме открылась выставка «Тайны старого дома», положившая начало экспозициям, посвященным городской художественной культуре.

25 июня 2010 года, в год 50-летия Архангельского музея изобразительных искусств, в отреставрированных залах усадебного дома открылась новая экспозиция русского искусства XVIII и начала XX века. Картины русских художников были размещены в анфиладе залов с паркетными полами, изразцовыми печами, расписными потолками и лепными украшениями, создающими атмосферу ушедшей эпохи.

Гордостью экспозиции являются живописные произведения таких мастеров, как Карл Брюллов, Владимир Боровиковский, Фёдор Рокотов, Иван Айвазовский, Алексей Венецианов, Карл Лемох, Иван Крамской, Михаил Нестеров, Валентин Серов и других.

На первом этаже находится выставочный зал, где проходят выставки, посвященные городской художественной культуре. Они знакомят посетителей с культурой и бытом старого Архангельска, рассказывая о жизни города через судьбы его жителей.