Собор Бразильской епархии белых эмигрантов из России был основан в 1934 году. 6 августа 1939 года в Сан-Паулу состоялось торжественное освящение Свято-Николаевского кафедрального собора, который стал одним из ведущих православных храмов страны. Со временем здесь появились архив и богатая библиотека.

После Второй мировой войны собор пополнился новыми прихожанами, прибывшими из СССР и Китая. Как и большинство приходов в Бразилии, собор отказался от объединения с Московским Патриархатом Русской Православной Церкви.

В настоящее время собором руководит священник отец Константин Бусыгин, потомок офицера Дроздовской артиллерийской бригады.