Среди густой лесной зелени возвышается Софрониевский Молченский Печерский монастырь, известный своим духовным наследием и величественной архитектурой. Основание монастыря связано с принятием христианства на Руси при князе Владимире Святославиче. Считается, что монастырь был основан монахами, бежавшими из Киево-Печерской Лавры после нашествия монголо-татар в 1240 году. Они нашли убежище в лесах на возвышенности, которую позже назвали "Чудной горой", рядом с болотом "Молче", давшим имя будущей Молчанской Пустыни. Сначала монахи вырыли пещеры для молитв, а затем начали строить монастырь.

Во времена князя Александра-Ольгерда здесь уже существовал благоустроенный монастырь под руководством архимандрита Филарета. Однако в конце XIV века он пришел в упадок из-за нашествия крымских татар. 18 сентября 1405 года один из местных жителей обнаружил на "Чудной горе" икону Пресвятой Богородицы, окруженную сиянием. Это событие стало началом строительства церкви на этом месте. Вскоре после этого Путивльское духовенство и власти получили разрешение от митрополита и московского князя на строительство церкви.

В конце XVI века в Путивле был построен храм, принадлежащий Молченской Пустыни. В 1591 году игумен Пафнутий приобрел участок земли в Путивле, где построил церковь. В 1602 году началось строительство нового монастыря, который вскоре стал самостоятельным Путивльским монастырем. В 1592 году крымские татары вновь разорили окрестности, включая Молченскую Пустынь. В 1605 году монастырь был разграблен поляками, и все его ценности были перенесены в Путивльский монастырь.

К 1605 году Молченская Пустынь была фактически упразднена, а ее городское подворье стало самостоятельным монастырем. На месте пустыни была построена деревянная церковь, позже замененная на каменный храм. В 1656 году настоятелем стал старец Софроний, который возродил монастырь и добился его самостоятельности. Его преемники продолжили развитие монастыря, строя новые храмы и здания.

При архимандрите Феодосии Маслове монастырь пережил расцвет. Феодосий, родом из Глухова, был энергичным и предприимчивым человеком. Он добился выделения новых земель для монастыря и построил на них монашеские кельи и храм. В монастыре находились несколько церквей, колокольня с библиотекой и другие здания.

С приходом советской власти многие храмы были разрушены, в том числе и Софрониевская Пустынь. В 1919 году монастырь был разграблен, а в 1920 году упразднен. На его территории разместили детский дом, а позже, концентрационный лагерь и штаб партизан. В послевоенные годы монастырь был окончательно разрушен, а его материалы использованы для строительства хозяйственных объектов.

В 1999 году монахи вернулись на руины монастыря, начали восстанавливать кельи и храмы. В 2001 году в монастырь вернулась Иверская икона Божией Матери, известная своей чудотворной силой.