Шелтозерский вепсский этнографический музей имени Р. П. Лонина посвящен культуре коренного малочисленного народа России, вепсов.

Музей был основан в 1967 году как народный, благодаря усилиям известного краеведа, писателя и собирателя вепсского фольклора Рюрика Петровича Лонина. За 13 лет существования народного музея были собраны уникальные коллекции, отражающие традиционные занятия и промыслы, быт и хозяйство, народные верования и праздники вепсов. В 1971 году Шелтозерский краеведческий музей был признан лучшим среди народных музеев республики. В 1980 году он получил статус государственного, став сначала отделом, а в 1987 году филиалом Карельского государственного краеведческого музея.

Первым директором государственного музея стал историк и исследователь Александр Павлович Максимов. Р. П. Лонин и А. П. Максимов совместно работали над созданием экспозиции вепсского музея, которая разместилась в отреставрированном доме Мелькиных, построенном в 1814 году. Главным экспозиционером выступил известный историк Михаил Юрьевич Данков, а художником, Дмитрий Учуваткин. В июне 1991 года дом Мелькиных открыл свои двери для первых посетителей.

В 2010 году музею было присвоено имя его основателя, и теперь он носит полное название Шелтозерский вепсский этнографический музей имени Р. П. Лонина.