Здание музея, построенное в 1953 году по проекту архитектора Зои Осиповны Брод, изначально служило кинотеатром "Родина", который открылся 21 февраля того же года. В подвале здания находились кассы и мастерская художника, а на втором этаже располагался буфет.

Кинотеатр "Родина" был местом проведения различных мероприятий: здесь показывали художественные и документальные фильмы, проходили сессии городского Совета, конференции, встречи с депутатами и артистами, детские новогодние утренники, торжественные собрания, а также работал кинолекторий для молодежи и клуб "Ровесник". Именно здесь отмечали первую юбилейную дату города Салавата, его десятилетие.

Идея создания музея истории города была впервые предложена 1 июля 1960 года историком и краеведом Газизом Мухамедьяновичем Галиным в газете «Ленинский путь». В 60-е годы выставки по истории города проводились в ДК "Нефтехимик" и школах. В сентябре 1966 года бюро горкома КПСС утвердило оргкомитет по организации музея, поручив горсовету найти помещение в течение месяца. Планировалось открыть музей в 1968 году к 20-летию города, но проект не был завершен, и школьников возили на экскурсии в музеи соседних городов.

Вопрос об открытии музея вновь подняли в 1986 году, начав реконструкцию первого этажа жилого дома на ул. Первомайской. 15 сентября 1989 года здесь открылась выставка Михаила Самуиловича Шнейдермана, что стало началом работы картинной галереи.

В 2004 году было принято постановление о реконструкции кинотеатра "Родина" под историко-краеведческий музей. Для благоустройства сквера за кинотеатром снесли исторический фонтан и памятник Горькому, убрали постаменты первых городских скульптур. Реконструкция кинотеатра затянулась, но благодаря общественности и рекомендациям Министерства культуры Республики Башкортостан, к декабрю 2008 года работы завершились. С 8 мая 2008 года музей вошел в состав "Картинной галереи".

Музей открылся 12 июня 2009 года, и в его фондах хранится более 4 тысяч экспонатов, включая палеонтологические, археологические, нумизматические и этнографические коллекции, а также книги, культовые предметы, фотографии и личные вещи известных людей. Среди экспонатов, бюст Салавата Юлаева работы Тамары Павловны Нечаевой и монеты XV и XVIII веков.

Музей активно сотрудничает с жителями города, которые безвозмездно передают вещи с культурно-исторической ценностью. В музее представлены разделы, посвященные истории "Земли Юрматы", быту местного населения и пришлых, а также рабочий кабинет директора комбината Березовского И. А. 50-х годов.

В музее регулярно проводятся тематические выставки и курсы для музейных работников. Сотрудники музея ежегодно собирают материалы в окрестных селениях. В 2011-2012 годах музей участвовал в акции "Ночь музеев".

Здание музея имеет прямоугольную форму с четырехскатной крышей, треугольный портик с полуциркульным окном на фасаде, колонны ионического ордера, утопленный вход и декоративные ниши. Внутренняя планировка проста, с анфиладой залов, а фойе украшено колоннами, зеркалами и лепниной.