Перынский скит, известный также как Перынский Рождества Богородицы мужской скит, был монастырём, который находился в новгородском урочище Перынь и функционировал с XIV века до 1764 года. Первое упоминание о нём в летописях датируется 1386 годом, когда новгородцы сожгли монастырь.

Сегодня Перынский скит продолжает своё существование и расположен в двух километрах от Юрьевой обители. В 1991 году Перынский полуостров вместе с церковью и другими постройками был передан Церкви, а в 2001 году храм был освящён. Археологические раскопки, проведённые в 1951-1952 годах, подтвердили существование на территории скита древнего языческого капища. В 1230-е годы деревянную церковь Рождества Богородицы заменили каменной, и, вероятно, тогда же был основан монастырь. Однако в летописях он впервые упоминается только в 1386 году.

В 1528 году в монастыре построили деревянную Троицкую церковь с трапезной, которая не простояла и ста лет: в начале XVII века монастырь был разграблен и сожжён шведами. К 1617 году его состояние было плачевным: храм разрушен, келий и ограды нет, а в монастыре остался лишь один старец Максим с крестом и пятью книгами. В 1634 году монастырь был приписан к Юрьевой обители. В 1764 году Перынский монастырь упразднили, а его постройки, кроме церкви, перевезли в Юрьеву обитель. Скит, основанный здесь в 1827 году по просьбе архимандрита Фотия, жил по уставу древних монастырей, и женщины могли посещать его только в день празднования Рождества Богородицы.

Первым начальником скита стал иеромонах Аникита Ширинский-Шихматов. В 1830-1840-х годах скит был обновлён и расширен: построили братский корпус и корпуса для начальника скита и юрьевского архимандрита, а также звонницу на двух каменных столбах с шестью небольшими колоколами и ограду.

После революции скит был закрыт. В 1920-е годы его использование остаётся неизвестным, а в 1930-е годы на его территории разместилась рыболовецкая артель. Звонницу и ограду разобрали, чтобы построить хранилище для льда.

После Великой Отечественной войны рыбный промысел в Перыни возобновился, а в 1960-е годы на месте бывшего скита появилась турбаза. Здесь проложили дамбу, построили домики для отдыхающих, обустроили окрестности, создали танцплощадку и установили статую Перуна.

Сегодня на Перынском полуострове снова звучат молитвы. Сюда приезжают не только паломники, но и туристы, и теперь женщины могут посещать скит круглый год. Главной достопримечательностью является церковь Рождества Богородицы, включённая в 1992 году в Список Всемирного наследия ЮНЕСКО. Этот храм, самый маленький каменный храм домонгольской постройки, был реставрирован в своём первоначальном виде, что создаёт светлое впечатление.