В XVII веке рядом с берегом реки Неглинки располагалось владение стольника И. М. Вердеревского, включавшее два дома на улице. В середине XVIII века оно перешло к графу П. Б. Шереметеву, а к началу XIX века стало собственностью генерал-майора и Георгиевского кавалера Е. И. Бланкеннагеля. В екатерининскую эпоху Егор Иванович Бланкеннагель руководил работами по прокладке реки через Неглинный канал и был членом комиссии по водяным работам в Москве.

Каменный дом Бланкеннагеля уцелел в пожаре 1812 года, а после его смерти в следующем году перешел к падчерице Александре Васильевне, супруге известного ученого и общественного деятеля Василия Назаровича Каразина.

С 1831 года в здании находилось отделение старейшего банкирского дома И. В. Юнкера из Санкт-Петербурга. В 1870-е годы "И. В. Юнкер" приобрел соседний дом № 16 на Кузнецком мосту и переехал туда. Также здесь долгое время располагался художественный магазин фирмы Дациаро.

В 1873 году бывший каразинский дом купил купец Константин Семёнович Попов, который первым заложил чайные плантации на Кавказе. Через четыре года он полностью перестроил дом, возведя по проекту академика архитектуры Александра Ивановича Резанова четырехэтажное здание в эклектическом стиле, украшенное лепниной в духе итальянского ренессанса и барокко. Строительными работами руководил архитектор С. В. Дмитриев. В те же годы Резанов построил для Попова особняк на Смоленском бульваре, позже перестроенный для М. К. Морозовой.

В "Пассаже Попова" на Кузнецком мосту разместились магазины известных фирм и фотографический салон А. А. Эйхенвальда. Помимо торговых помещений, здесь были демонстрационные залы, где проходили художественные выставки и выставки декоративных тропических растений. Верхние этажи занимали жилые квартиры.

"Пассаж Попова" сыграл важную роль в телефонизации Москвы. Здесь 13 июля 1882 года компания телефонов Александра Белла открыла первую московскую ручную телефонную станцию на 800 номеров.

В 1899 году дом № 12 приобрели банкиры, братья Иван, Исаак, Николай и Афанасий Исааковичи Джамгаровы, которым уже принадлежал другой дом на Кузнецком мосту, на углу с Рождественкой. Пассаж стал называться "Пассаж братьев Джамгаровых".

В начале XX века на первом этаже находилась кофейня и кондитерская торгового дома "Сиу С. и К°" с интерьерами в стиле Арт Нуво.

После революции в здании размещались различные государственные учреждения и несколько научных медицинских обществ.

В настоящее время в бывшем пассаже Попова и Джамгаровых располагается Государственная публичная научно-техническая библиотека России.

Здание охраняется государством как объект культурного наследия регионального значения.