С момента постройки Зилантова монастыря в камне, в нем сменилось четыре колокольни, не считая деревянных предшественниц. Ни одна из них не выделялась высотой среди окружающих зданий. Сам монастырь располагался на высокой горе и был виден издалека, но места для большой звонницы не было. До XIX века колокола висели при церквях, как в древних храмах Новгорода и Пскова. Эти колокола оставались старыми и ценными до революции. Первая звонница находилась при Успенском соборе, что было традиционно для главных храмов. Такое положение сохранялось до 1829 года, когда Всехсвятскую церковь перестроили и освятили заново, и колокольня переместилась к ней. Один из пяти малых колоколов остался при Успенском соборе, а старую колокольню разобрали. Новая звонница заняла необычное место над крышей Всехсвятского храма и оставалась там почти 70 лет. В 1898 году появилась первая отдельно стоящая колокольня, построенная архитектором Ф.Н. Малиновским в русском стиле. Она располагалась над Святыми вратами монастыря, на южной стене. Современные паломники могут увидеть её только на старых фотографиях.

Век назад паломники, подходя к монастырю, видели величественный вид: стены и башни обители напоминали белокаменный Кремль. Колокольня в древнерусском стиле усиливала это сходство. Она напоминала башни Московского Кремля, особенно Спасскую башню, но в миниатюре. Почти 30-метровый столп устремлялся в небо, а рядом возвышался шатер церкви Всех Святых. Ворота под колокольней вели в монастырь, их изящная тройная арка символизировала Святую Троицу. Этот прием архитектуры был удачно возрожден Малиновским, мастером старинных традиций. По бокам ворот находились окна келий.

Над воротами возвышался столп колокольни, переходящий из четверика в восьмерик, где под шатром находились колокола. По углам четверика были четыре купола, повторяющие расположение куполов вокруг шатра Всехсвятского храма. Это подчеркивало единство замысла храма и колокольни. Украшения колокольни из фигурного кирпича напоминали украшения соседней церкви и других работ Малиновского, таких как Троицкий собор в Раифе или Скорбященский-Богородицкий в Свияжске.

Святые врата с колокольней и ограда монастыря были полностью разобраны в 1932 году.