Аджимушкайские каменоломни являются одним из важнейших памятников боевой славы Керчи, города-героя. Эти подземные сооружения не раз служили надежной крепостью в борьбе с врагами.

Особенно значимой страницей в их истории стала героическая оборона подземных гарнизонов Центральных и Малых Аджимушкайских каменоломен в мае и октябре 1942 года. В этой борьбе бойцы и командиры Красной Армии проявили невероятную стойкость, героизм и преданность Родине, демонстрируя высочайшие моральные качества и верность воинской присяге.

В мае 1942 года гитлеровские войска начали наступление на Акмонайском перешейке. Измотанные постоянными боями и бомбардировками, под давлением вражеских танков войска Крымского фронта отступали к Керченскому проливу, где 14 мая началась переправа советских войск на Таманский полуостров. Часть подразделений закрепилась у Аджимушкайских каменоломен и на заводе Войкова, чтобы сдержать врага и обеспечить эвакуацию основных сил. До 16 мая бои шли на поверхности, но когда противник окружил отряд, несколько тысяч бойцов и командиров ушли в подземелье, чтобы продолжать борьбу.

В Центральных Аджимушкайских каменоломнях был сформирован гарнизон численностью более 10 000 человек под командованием полковника П. М. Ягунова, а после его гибели, подполковника Г. М. Бурмина. Комиссаром был старший батальонный комиссар И. П. Парахин, начальником штаба, старший лейтенант П. Е. Сидоров, также в гарнизоне были местные жители.

На протяжении 170 дней и ночей подземные лабиринты Аджимушкая оставались сражающейся крепостью. Несмотря на острую нехватку пищи, воды и боеприпасов, бойцы подземного гарнизона, верные присяге, совершали смелые ночные операции, нанося врагу ощутимые потери.

В Малые Аджимушкайские каменоломни ушли остатки различных подразделений, объединившись в боеспособную часть. Гарнизон Малых катакомб насчитывал до трех тысяч бойцов, и до августа 1942 года его возглавлял подполковник С. А. Ермаков, затем старший лейтенант М. Г. Поважный. Политработой руководил батальонный комиссар М. Н. Карпекин. В жестоких боях с врагом, под обвалами, от газов, голода, ран и болезней бойцы подземной крепости гибли, но оставались верными своему долгу и Родине.

Прошло много лет после окончания войны, прежде чем начались активные поиски и исследования этой малоизвестной страницы Великой Отечественной войны. В 1965 году было принято решение об увековечивании подвига павших. В мае 1967 года музей принял первых посетителей, а в мае 1982 года, к 40-летию Аджимушкайской обороны, был открыт мемориал по проекту скульпторов Б. Е. Климушко, Е. Е. Горбань и архитектора С. П. Миргородского.

Мемориальный комплекс «Героям Аджимушкая» включает музей истории обороны каменоломен, подземную экспозицию и выставки в пилонах. Постоянно действующая подземная выставка подробно рассказывает о подвиге и реликвиях обороны Аджимушкая.

После экскурсии по подземному музею посетители могут самостоятельно осмотреть выставки в левом пилоне. Первая выставка «Мы уполномочены погибшими» знакомит с работой поисковых экспедиций «Восточно-Крымского ИКМЗ» и некоторыми документами, которые помогли узнать больше о борьбе подземных гарнизонов. Выставка «Реквием Крымскому фронту» рассказывает о трагических событиях февраля и мая 1942 года, о тяжелом поражении Крымского фронта. Уникальное панно «Героям Аджимушкая», выполненное в технике энкаустики, никого не оставит равнодушным.

В 2015 году сотрудники музея-заповедника создали новый мемориальный зал, посвященный героям Аджимушкая, который стал итогом более чем 40-летней исследовательской работы «Восточно-Крымского ИКМЗ».