Колокольня находится на Торговой стороне Ярославова Дворища, в нескольких метрах к западу от Никольского собора и к северу от церкви Жен Мироносиц. С обеих сторон её окружает каменное двухэтажное здание городского училища XIX века, которое закрывает два-три нижних яруса колокольни и соединяет её с воротной башней гостиного двора.

В дореволюционных и советских источниках колокольня датируется концом XVII века. В 1970 году С.И. Сивак обнаружила в библиотеке Академии Наук поврежденную рукопись того же периода, где упоминаются строительные работы на Ярославовом Дворище. Из документа следует, что колокольня была построена за два осенне-летних сезона 1684-1685 годов, а завершение работ пришлось на сентябрь 1685 года. На колокольне висели несколько колоколов: в середине XIX века их было шесть, а к концу века, восемь. Самый большой из них, весом 61 пуд, был отлит в 1652 году. В конце 1687 года его отвезли в Москву, а вместо него установили новый колокол весом 106 пудов.

Колокольня пострадала в результате сильного пожара 1696 года, когда на Торговой стороне сгорели все церкви и лавки, кроме церкви Бориса и Глеба.

Во время Великой Отечественной войны памятник пострадал меньше, чем другие здания города: в стенах были повреждения от пуль и снарядов, пострадало покрытие шатра, отсутствовали полы и заполнения проемов.

В настоящее время колокольня сохранилась в основном в хорошем состоянии, хотя большая часть колоколов утрачена, сохранились только два.

Колокольня относится к пятиярусным шатровым сооружениям типа "восьмерик на четверике". Внутри она разделена сводами или перекрытиями на пять ярусов. Это характерный пример шатровой колокольни, распространенной в Новгороде в конце XVII века, и она имеет важное градостроительное значение.