Село Кырчаны издавна служило важным перекрестком, объединяя Казанский, Нолинско-Глазовский и Ижевский тракты. До 1780 года оно было главным поселением в округе. Основанное в 1663 году, село сразу обзавелось деревянной церковью, которая со временем обветшала. В 1699 году иерей Иоанн Макарьев вместе с прихожанами, включая церковного старосту Прохора Городилова и мирского старосту Василия Емельянова, подали прошение на строительство новой церкви. Казанский митрополит Тихон 18 октября 1699 года выдал разрешение на возведение каменного храма.

Строительство началось около 1760 года. По переписи 1763 года в селе насчитывалось 155 душ. Основные работы завершились к 1773 году. Зимой велись подготовительные работы, а летом, строительные. Каменщики, чьи имена не сохранились, украшали церковь по своему усмотрению. Кирпичи носили вручную, а раствор укрепляли яйцами. В холодном храме освятили престол в честь Святой Троицы, а в теплом, в честь Богоявления и Рождества Богородицы.

В 1887 году Троицкая церковь описывалась как квадратное здание с восьмигранным вторым ярусом и глухим сводом. Храм имел высоту 17 саженей, длину и ширину по 6 саженей. Тёплый храм перестраивался в 1838 и 1866 годах. Его размеры составляли 12 саженей в длину, 6 в ширину и 5,5 в высоту. Стены были украшены кирпичными элементами, а крыша имела восьмискатную форму. Колокольня, построенная в 1761 году, была отдельно стоящей.

Церковь отличалась широким восьмериком, что придавало ей башнеобразный вид. Колокольня была отдельно стоящей, а колокола отливали в городе Слободском. Самый большой колокол весил 250 пудов. Первоначально храм венчался куполом «курмой», позже его переделали. Церковь ремонтировалась и перестраивалась в 1828, 1838 и 1864-1871 годах. Приход состоял из 49 селений, в которых проживали более 8700 человек.

Воспоминания о церкви оставили А. В. Краснопёрова и В. Д. Молчанова, чьё детство прошло в 1930-е годы. Церковь была белокаменной с красивыми крестами. Звон колоколов был «малиновым» и «серебряным». В церкви была «палатка» для приезжих, а стены были расписаны яркими красками. В селе жили священники из рода Васнецовых, а в конце XIX века открылась церковно-приходская школа.

После революции судьба церкви изменилась. В 1935 году село стало районным центром, что ускорило уничтожение храма. Церковь закрыли и переоборудовали под школу. Колокола сбросили, а здание использовали как общежитие. В предвоенные годы храм начали разбирать, но из-за прочного раствора это оказалось трудоёмким. Колокольню использовали как мастерскую и магазин.

В 1997 году сильная гроза повредила колокольню. Несмотря на её статус памятника архитектуры, реставрация долгое время не проводилась. В начале 2000-х предприниматель из Уржума решил спонсировать ремонт. Однако местная администрация не поддержала инициативу, и работы затянулись.

В 2003 году реставрация началась благодаря поддержке мецената Владимира Култышева. Колокольню очистили, но шпиль демонтировали, что изменило её облик. Тем не менее, колокольня остаётся видимой издалека. Она уникальна тем, что имеет два фасада и является копией колокольни кафедрального собора в Вятке, разрушенного в 1935 году. Сохранение колокольни увеличивает её ценность как редкого архитектурного памятника.