Музей был открыт 1 октября 1992 года благодаря усилиям многих людей, особенно ветеранов и организатора Л.И. Есиповой, которые собрали здесь богатую историю края.

Идея создания музея возникла в 1985 году, когда общество поверило в перестройку и культурное возрождение. В январе 1986 года на заседании совета ветеранов появилась инициатива создать музей в Кильмези. Лидия Ивановна Есипова, член Союза журналистов СССР и пенсионерка, стала инициатором и первым директором музея. Жители района активно откликнулись на просьбу предоставить старинные предметы для будущего музея, и начался сбор экспонатов. Ветераны войны и труда приняли в этом активное участие, так как история района была им особенно близка и понятна. Вопрос с помещением для музея решался не сразу. Долгое время экспонаты хранились в доме Есиповых. Лишь благодаря настойчивости совета ветеранов и администрации района, а также поддержке членов райпо, пустующее здание бывшего магазина, ранее принадлежавшее купцу И.М. Выгодчикову, было передано Народному дому, где и разместился музей. Несмотря на множество проблем, они постепенно решались.

На момент открытия в музее были представлены отделы истории, археологии, природно-геологический и этнографический.

С годами музей развивался и менялся. В 1998 году открылась диорама с животными и птицами района. В октябре 2004 года появились зал Боевой Славы и коллекционный зал, а также новые экспозиции: «Как рубашка в поле выросла», посвященная льноводству, и «Растительность Кильмезского района», где представлены все виды деревьев и кустарников района.

В 2006 году была проведена реставрация и открыта экспозиция «Ими славится Кильмезская земля».

Сегодня музей включает одну коллекционную комнату и четыре зала: истории, природы, выставочный и зал Боевой Славы.

Здание музея, построенное в конце XIX века, является одним из красивейших в Кильмези. Это бывший купеческий магазин, принадлежавший до революции купцу И.М. Выгодчикову, хотя памятником архитектуры оно не является.

Музей предлагает экскурсии: «Природа нашего края», «История крестьянского быта», «До революции Кильмезь была глухим селышком…», «Наш край в годы установления Советской власти и гражданской войны», «Кильмезь в годы Великой Отечественной войны», «Они сражались за Родину» о кильмезянах, Героях Советского Союза, «Наш поселок сегодня» и «Еще живут старинные дома» по улицам поселка.