Церковь Марии-Магдалины служит домовым храмом, где проходят службы и молятся исключительно монастырские обитатели. Это небольшое каменное здание с одним четвериком, увенчанное шатром и крестом, установленным на глухом каменном барабане.

В настоящее время здание находится на стадии реконструкции. К нему пристроен притвор, и оформляется вход. Церковь построена из природного камня и расположена у монастырской стены, рядом с Покровской церковью.