Название слободы Томаровка происходит от фамилии её владельца в конце XVII века, Ивана Томарова. Он и его сыновья, Борис и Василий, владели этой землёй с 1690 по 1698 год. Первые жители Томаровки были беглыми крепостными крестьянами, которые активно переселялись в "украинные города" Белгородской черты во второй половине XVII века.

В начале XVIII века слобода стала вотчиной графа Гавриила Ивановича Головкина, приближённого к Петру I. Головкин поселил здесь черкас, выходцев из Украины, которым были предоставлены льготы, такие как вечное владение землёй и беспошлинная торговля. Черкассы занимались кустарными промыслами, особенно выделялся кожевенный промысел. Культура и речь жителей Томаровки свидетельствуют о их связи с Украиной и Поднепровьем.

Став вотчиной графа Головкина, Томаровка привлекала торговлю и базары из Карпова, благодаря своему удобному расположению и значительной численности населения. В середине XVIII века она стала одним из главных населённых пунктов Карповского уезда, что привело к перемещению социально-экономического центра из Карпова в Томаровку.

В 1802 году была образована Томаровская волость, вошедшая в состав Белгородского уезда Курской губернии. В первой половине XIX века слобода перешла к княжескому роду Салтыковых, благодаря родственным связям. В середине XIX века она принадлежала коллежскому асессору князю Алексею Александровичу Салтыкову.

К концу XIX века в Томаровке было три каменных храма: Архангела Михаила, трёхпрестольная Никольская церковь (построенная в 1851 году и разобранная в 1938-1939 годах) и Казанская церковь (1869 года постройки), которая сохранилась до наших дней.

Церковь Архангела Михаила, построенная в 1841 году в центре Томаровки, была выполнена в стиле классицизма и имела форму креста с высокой колокольней. В начале 1930-х годов её закрыли, колокольню разобрали, а здание использовали как зернохранилище. Осенью 1941 года церковь выгорела изнутри, а при освобождении Томаровки в 1943 году была сильно разрушена. В 1946-1947 годах её взорвали, а кирпичи использовали для строительства районного Дома Культуры, который сгорел в декабре 1991 года.