Церковь Рождества Пресвятой Богородицы в станице Лысогорской была возведена в 1886 году мастерами из Воронежа, приглашёнными казаками. Размеры церкви определили по длине шкуры барана, нарезанной на узкие полоски. Существует легенда: казаки обратились к атаману Брянцеву за разрешением на строительство, привезя в подарок лучшего барана. Атаман, приняв дар, согласился, но с условием, что церковь должна уместиться на шкуре барана. Казаки нарезали шкуру на тонкие ленточки и соединили их в длинную верёвку. Место для храма выбирали долго, споря на казачьем круге. Жребий бросили, и маленькая Васютка Амехина выбрала бумажку с указанием места, где и построили церковь. Казаки обозначили размеры будущего строения колышками, натянули верёвку и пригласили атамана, который остался доволен и одобрил строительство. Церковь построена из деревянных брусьев, закреплённых в пазы, без использования гвоздей. Чернорабочими были екатерининские солдаты, провинившиеся в русско-турецкой войне (1875-1877 гг.).

Храм был освящён в 1898 году, главный престол посвящён Рождеству Пресвятой Богородицы. Строительство велось с 1875 по 1877 годы (или 1886-1887 годы). При возведении храма в конце XIX века под фундамент рыли траншеи и укладывали привозной камень. Пока камень давал усадку, по Дону завозили лес. Стены возводили без гвоздей, в пазы. Кровлю сразу покрыли железом. Установили колокола: один большой весом 500 кг на левую колокольню и шесть меньших на правую. В 1935 году колокола сбросили и отправили на переплавку. Необходимость строительства нового храма была связана с перемещением станицы на другой берег реки Подкумок.

Храм был закрыт с 1937 по 1942 год. Приход сохранился благодаря председателю колхоза Пискарёву Н.А., который настоял на использовании храма под ток, установив в нём веялки. За это Николай Архипович был осуждён. С 1937 по 1940 годы в крестильне была изба-читальня, а с 1940 по 1942 годы, школа и госпиталь.

Храм сохранился в неизменном виде; была проведена реставрация иконостаса, но мастера лишь восстановили недостающие детали, сохранив внутренний облик. В 1979 году был немного удлинён правый клирос.