В 1873 году настоятель скита, преподобный старец Иларион, страдал от продолжительной и тяжёлой болезни, которая навела его на мысль о необходимости создания благоустроенной больницы для больных братии. Отец Иларион завещал казначею монастыря, отцу Флавиану, своему духовному сыну, построить новую больницу. Для этого, с согласия старца Амвросия, он передал около 30 тысяч рублей, собранных из скитских сбережений и пожертвований монахов и добровольных послушников.

После смерти старца Илариона в 1874 году за монастырской оградой была возведена новая двухэтажная больница с храмом, посвящённым преподобному Илариону Великому. В советское время храм был закрыт. После возрождения обители в 1991 году состоялось освящение храма, а в 2000-х годах была проведена роспись и установлен иконостас.

В настоящее время в храме Илариона Великого совершаются таинства крещения и проводятся беседы богомольцев с духовниками обители.