В церковной летописи села Становой Колодезь за 1889 год упоминается, что Преосвященный Мисаил, епископ Орловский и Севский, дал разрешение на строительство нового каменного храма, так как деревянная церковь 1849 года постройки, освященная в честь Покрова Пресвятой Богородицы, уже не могла вместить всех прихожан. 20 августа 1889 года прошло торжественное богослужение с участием священников из соседних сел, после чего было освящено место для нового храма. Строительство прекратилось с наступлением холодов, но возобновилось весной следующего года.

Храм строился при поддержке ктитора и крестьян, а руководил процессом церковный староста Максим Александрович Тиняков, купец и выходец из крестьян, который пожертвовал значительные средства. К 1892 году здание было завершено, и началась внутренняя отделка. В 1895 году завершилось строительство церковной ограды и караулки, а также были расписаны купол и стены храма. Освящение нового трехпрестольного храма состоялось 21 декабря 1895 года с участием Преосвященного Мисаила и священнослужителей из Орловской губернии.

В 1897 году священник Андрей Оболенский и староста Максим Тиняков получили разрешение от епископа Митрофана на строительство придельных иконостасов, которые были заказаны мастеру Абашееву. 16 июня 1898 года епископ Митрофан освятил придельные иконостасы, и в этот день храм не смог вместить всех молящихся. В марте 1898 года было разрешено продать старый деревянный храм, который вскоре был продан и перевезен на станцию Поныри.

После прихода к власти большевиков храм некоторое время продолжал функционировать, но в 30-е годы службы стали проводиться тайно. В конце 30-х годов храм был закрыт, и его здание использовалось как зерносклад. В 1938 году здание перестроили под школу, использовав для строительства могильные плиты с церковного кладбища.

Во время фашистской оккупации здание служило немецким госпиталем, и, возможно, на его территории было немецкое кладбище. В июле 1943 года здание пострадало в ходе боев, и после освобождения села его восстановили как школу. В 1987 году рядом построили новую школу, а старое здание оставили без присмотра.

Восстановление храма началось с инициативы жителей села, которые обратились за помощью к схиигумену Илию. Благодаря его поддержке и пожертвованиям от жителей и фирм со всей России, храм начали восстанавливать. В 1993 году был освящен небольшой храм, а в 2000 году, на праздник Казанской иконы Божией Матери, состоялось освящение восстановленного храма Покрова Пресвятой Богородицы.

При храме работает воскресная школа, и с каждым годом число прихожан увеличивается, привлекая людей из соседних деревень и города Орла.