В 1827 году на месте нынешней обители была построена и освящена деревянная церковь в честь Казанской иконы Божией Матери. Церкви принадлежали две десятины земли. Из архивов Санкт-Петербурга известно, что при храме функционировала воскресная школа. Казанская церковь стояла до 1926 года, когда по распоряжению местных властей её частично разрушили и переоборудовали под сельскую школу. Во время Великой Отечественной войны, в период немецкой оккупации, здание использовалось как штаб, столовая и конюшня. После войны оно снова стало сельской школой.

В 1992 году в селе Большегнеушево была построена новая школа, а старое школьное здание передали Курской епархии для использования в качестве храма. В 1996 году архимандрит Ипполит (Халин), настоятель Рыльского Свято-Никольского мужского монастыря, обратился в Курскую епархию с просьбой разрешить реконструкцию здания школы для приходского храма и создания женского скита. Получив благословение митрополита Иувеналия (Тарасова), архимандрит Ипполит вместе с первыми насельницами скита, при поддержке благодетелей и паломников, приступил к восстановительным работам. Вскоре здание храма было отремонтировано, территория обустроена и организовано хозяйство.