Казаки Поповичевского куреня ЧКВ возвели две Богоявленские церкви. Первая из них, деревянная, с колокольней, но без фундамента, была построена к 1799 году, когда курень находился в своем первом поселении у Красного леса. Первым священником стал Стефан Твердомед, который умер в 1803 году, а его жена Елена, родившаяся в 1770 году, упоминается в ревизской сказке 1816 года. В 1808 году, при переселении куреня, церковь разобрали и перевезли в новое поселение на Понуре, где она начала функционировать с лета 1809 года. Со временем церковь стала тесной из-за роста населения, поэтому в 1833 году рядом с ней, ближе к реке, начали строительство новой Богоявленской церкви. Она также была деревянной, с колокольней, но уже на кирпичном фундаменте. Строительство велось без использования гвоздей, на шипах и клиньях. В 1838 году, вместе с правым, Матвеевским приделом, церковь была введена в эксплуатацию. С тех пор обе церкви стояли рядом и функционировали. В 1843 году в них служили священники Лев Алексеев и Стефан Рыбальский, диакон Иоанн Павленко, дьячок Алексей Закиревский и пономари Григорий Вихрицкий и Стефан Коколевский.

В 1855 году строительство новой церкви завершилось пристройкой левого придела во имя святого великомученика Пантелеймона. Церковь освятили в 1856 году, потратив на строительство 9714,3 рубля серебром, собранных станичниками и добровольными пожертвованиями. Эта церковь до сих пор действует и является одним из немногих деревянных храмов на Кубани, памятником церковной архитектуры. Старую церковь снесли около 1880 года из-за ветхости. После этого Епархия разрешила разобрать общие для двух церквей ограду и сторожку и построить новые для оставшейся Богоявленской церкви. С тех пор церковная площадь имеет почти квадратную форму с размерами сторон около 150 метров. Лишь недавно на южной стороне площади появились новые строения и коммуникации.

В новой сторожке 7 декабря 1886 года священник Парадиев открыл школу грамоты, а псаломщик Кондратов подарил мебель и книги для первых 37 учеников. Внутри церкви легко оценить её первоначальные размеры: длина вместе с колокольней составляла около 25 метров, а высота до карниза, около 4,5 метров. Ширина помещения изначально ограничивалась южной и северной стенами. После пристройки приделов эти стены вырезали, подперев верхние части чугунными опорами, которые теперь находятся в середине помещения, увеличив его ширину до 24 метров. Священник Василий Ключанский был награждён бархатной фиолетовой скуфьей в 1910 году, а священник Ф.И. Дудкин стал протоиереем в 1912 году. Местный казак Федот Лях был утверждён церковным старостой в 1913 году.

Памятным событием стало посещение Богоявленской церкви 28-29 мая 1916 года епископом Ейским Иоанном, который провёл всенощное бдение, Божественную литургию и вместе с местным священником Николаем Соболем произнёс проповедь.

После установления советской власти в 1920 году Богоявленскую церковь закрыли и превратили в склад. Уважаемые станичные священники Василий Ключанский и Николай Соболь были расстреляны. Церковь вновь открыли немецкие оккупанты, и с осени 1942 года богослужения в ней возобновились и продолжаются до сих пор.