Официальной датой основания музея считается 28 мая 1970 года. В 1982 году за достижения в краеведческой и поисковой деятельности Министерство культуры РСФСР присвоило музею звание «Народный».

Изначально музей располагался на улице Красной, 39, но из-за постоянного пополнения коллекции помещения стали тесными. В 1987 году по решению исполкома городского совета народных депутатов музею выделили два этажа здания на улице Красной, 68.

В 1992 году по распоряжению главы администрации города Кропоткина здание было полностью передано музею. Сегодня он находится в историческом здании начала XX века.

В музее постоянно действуют экспозиции:

«Кубань в эпоху каменного века»;

«Народы Прикубанья в эпоху бронзы, железа и средних веков»;

«Адыги, коренное население Кубани (XIII, XIX вв.)»;

«Первые редуты на Кубани. Пост у "Горелого дуба" (конец XVIII, середина XIX в.)»;

«Станция Кавказская (1874, 1913 гг.)»;

«Романовский, Кропоткин. Путь от хутора до города (1900-е годы, 1921 г.)»;

«Великий сын Отечества (П. А. Кропоткин)»;

«Город Кропоткин в годы военного лихолетья (1941, 1945 гг.)».