Согласно архивным документам 1843 года, фасад дома претерпел значительные изменения по сравнению с первоначальным видом. Лепной декор был снят, а оконные проемы мезонина и первого этажа переделаны в дверные. Колонны портика стали тоньше и были украшены резными капителями. К 1868 году главный фасад лишился шестиколонного портика, а оконные проемы были оформлены горизонтальными карнизами или сандриками. В ноябре 1896 года усадьбу приобрела семья железнодорожных магнатов фон Мекк. Впоследствии дом несколько раз переходил к новым владельцам, которые перестраивали его по своему усмотрению.

Ко второй половине XX века здание оказалось в аварийном состоянии. На фотографиях того времени видно, что фасад сильно обветшал, а на мезонине отсутствовали штукатурка и балкон. В ходе реставрации 1980-х годов было решено вернуть зданию облик 1834 года, используя архивные чертежи. В результате на главном фасаде вновь появились портик и лепнина, количество колонн увеличилось до шести, а мезонин был оштукатурен и дополнен балконом.

Существует версия, что в подвале этого особняка проживал главный герой романа «Мастер и Маргарита» Михаила Булгакова. Сам писатель с женой Любовью Белозерской недолго жил по соседству, в доме номер 9. На углу Обухова переулка (переименованного в Чистый в 1922 году) и Пречистенки находился знаменитый калабуховский дом из повести «Собачье сердце», где жил профессор Преображенский. В Чистом переулке Булгаков также написал пьесу «Дни Турбиных» и повесть «Роковые яйца». Поэтому этот переулок и его окрестности часто упоминаются в путеводителях по Москве как «булгаковские места».