Мензелинский уездный тюремный замок, старейшее из сохранившихся исправительных учреждений, был построен в 1806 году. Его возведение началось в период правления Екатерины II и завершилось при Александре I. В 1878 году здание было расширено и реконструировано, а также обнесено кирпичной стеной благодаря усилиям местного тюремного комитета. С 1886 года во дворе стали исполнять смертные приговоры.

В 1831 году была утверждена Тюремная инструкция «О церкви», которая детально описывала правовой статус православной церкви и порядок проведения религиозных обрядов заключенными. Лишь в 1896 году на втором этаже административного корпуса тюрьмы была возведена надстройка с большими окнами, где обустроили церковь, освященную в честь Михаила Архангела. К началу XX века наличие церковных помещений стало обязательным для всех пенитенциарных учреждений, а согласно Закону от 15 июня 1887 года, священнослужители этих храмов были включены в управленческий аппарат.

После событий октября 1917 года церковь в тюрьме была упразднена, а в советское время незаметно разобрали и саму надстройку. Тем не менее, старейший уездный тюремный замок сохранился и продолжает выполнять свои функции, сейчас здесь находится следственный изолятор №4.