Усадьбу «Чудовская Лука» Николай Алексеевич приобрел в 1871 году. С 1871 по 1876 годы Н.А. Некрасов неоднократно приезжал в свой охотничий домик. В последний раз он посетил его летом 1876 года, когда уже сильно болел, но продолжал работать над четвертой главой поэмы «Кому на Руси жить хорошо». В июле того же года Некрасов отправился в Крым и больше не возвращался в свое Чудовское имение.

Первая музейная экспозиция в охотничьем домике поэта была открыта в декабре 1971 года. В 1983 году состоялась первая реэкспозиция музея. В декабре 2002 года Дом-музей Н.А. Некрасова закрыли на реставрацию и реэкспозицию. В ходе работ укрепили фундамент, заменили нижние венцы дома, обновили обшивку фасадов по образцам того времени, восстановили первоначальную планировку здания и перестроили лестницу между этажами.

Дом-музей является Чудовским филиалом Новгородского музея-заповедника.