Церковь во имя Всех Святых была возведена в 1884 году. Её стены и все архитектурные элементы, такие как карнизы, пилястры и наличники, были изготовлены из белого инкерманского камня. Этот белоснежный храм напоминал парадную форму российских моряков. Проект церкви разработал капитан инженерной службы Российского флота Матвей Соломонович Нич, который также руководил её строительством.

Архитектура церкви выполнена в стиле старорусского церковного зодчества. Центральная часть здания имеет квадратную форму и увенчана высоким куполом. Свет в храм проникает через узкие стрельчатые окна с витражами. Размеры церкви составляют 29,5 на 8,4 метра.

Рядом с церковью Всех Святых, напротив центрального рынка, расположено старое городское кладбище. Его ворота, также сделанные из белого инкерманского камня, признаны памятником архитектуры. На кладбище сохранилось множество исторических памятников, здесь похоронены многие почётные жители Феодосии, включая Матвея Соломоновича Нича, который умер в год завершения строительства храма.

Церковь простояла более семидесяти лет, пережив Первую мировую войну, революцию, гражданскую войну и Великую Отечественную войну, но в 1961 году её признали аварийной и решили снести. Здание оказалось настолько прочным, что для его разрушения пришлось привлечь военных подрывников. Взрывные работы проводились тайно ночью, и утром на месте храма осталась лишь груда развалин. В том же году умер последний священник храма, о. Евгений, и был похоронен на кладбище.

В 1978 году кладбище закрыли из-за нехватки места для захоронений. Оно стало заброшенным, постепенно разрушалось и подвергалось вандализму.

Восстановление храма началось в 1992 году. Архитекторы по старым чертежам и фотографиям создали рабочий проект. Подсобное помещение, построенное в 1903 году, временно использовалось как малый храм для богослужений. Благодаря усилиям о. Михаила Сытенко в 1999 году начались строительные работы, завершившиеся в 2003 году. Новый храм стал ещё красивее прежнего. Его внутренние стены расписаны группой художников под руководством Елены Маковей, и аналогов таких росписей нет. Стены покрыты тонким слоем золота, на котором выполнена живопись.

При храме открыта Духовная школа и небольшой музей, развитие которого поддерживает попечительский совет «Храни и помни», созданный в 2000 году. Совет также участвует в благоустройстве старого кладбища, планируется создание мемориала и лапидария. Разработаны экскурсионные маршруты по кладбищу, ведущие к историческим памятникам и захоронениям известных деятелей, медиков, педагогов, лётчиков-испытателей, моряков и братским могилам погибших в годы войн.