В 1691 году жители города обратились к Патриарху Адриану с просьбой благословить строительство монастыря в честь Вознесения Господня. Получив одобрение, старец Филарет возобновил работы по возведению обители. В том же году началось строительство деревянной Вознесенской церкви, на которую по просьбе Филарета была выделена небольшая сумма из царской казны. В 1694 году церковь была завершена. Значительный вклад в развитие монастыря внес архимандрит Августин, который стал его настоятелем в 1848 году. При его руководстве было построено большинство зданий. В 1852 году возвели каменный холодный Вознесенский храм с пятью главами, покрытыми белой жестью. Главный купол украшал позолоченный крест, а малые купола, деревянные кресты, обшитые железом.

С приходом советской власти, как и многие другие монастыри в России, обитель прекратила свою деятельность. По решению Средне-Волжского облисполкома от 17 декабря 1928 года Вознесенская церковь была закрыта. В 1933 году комбинат «Союзплодовощ» арендовал у местных властей два храма монастыря. В Феодоровской церкви сначала разместили водонапорную башню, затем гараж завода, а с 1970-х годов, склад. В храме Вознесения Господня устроили клуб. В 1993 году, по инициативе протоиерея Григория Коберника, администрация Сызрани приняла решение о передаче сохранившихся зданий монастыря Русской Православной церкви. После празднования тысячелетия Крещения Руси началось возрождение храмов и монастырей. 24 июня 1996 года архиепископ Самарский и Сызранский Сергий вновь освятил соборный Вознесенский храм и провел в нем Божественную Литургию. В монастыре поселились монахи и послушники, стремящиеся восстановить его первоначальный облик и возродить истинную монашескую жизнь.