В Заонежье сохранилось 39 культовых архитектурных объектов. Среди них выделяется церковь Николая Чудотворца, расположенная в центре группы деревень, позднее объединенных под названием Вегоруксы. Церковь стоит на небольшом холме, окруженном с трех сторон старым кладбищем. Это клетская церковь, построенная из бревен и соединенная с колокольней. Колокольня выполнена в виде восьмерика на четверике и увенчана высоким шатром с главкой. Интерьер церкви отражает характерную для конца XIX века тенденцию объединения молитвенного зала с притвором трапезной путем удаления разделяющей их стены.

Церковь входила в Великогубский приход, который включал около десятка часовен и три церкви, две из которых находились в Великой Губе. Никольская церковь расположена на южной части восточного берега Уницкой губы Онежского озера и обслуживала обширную территорию, включая оба берега Уницкой губы и частично Лижемскую.

История храма началась с постройки в середине XVIII века клетской часовни и отдельно стоящей шатровой колокольни, соединенных переходом. В конце XIX века, по просьбам прихожан, часовня была перестроена в церковь, так как в деревянной церкви Великой Губы службы больше не проводились из-за ветхости. После получения разрешения и сбора средств были пристроены алтарь, расширено храмовое помещение и переделан переход. Из-за нехватки средств работы продолжались после освящения храма, и только в начале ХХ века церковь приобрела окончательный вид. За счет пожертвований была возведена ограда вокруг церкви, а в 1895 году открыта церковно-приходская школа.

Данных о ремонте церкви после 1917 года нет. В ХХ веке храм обветшал, и в начале 1990-х годов началась его реставрация. К этому времени ценные иконы были вывезены Карельским музеем изобразительных искусств, а роспись и конструкции «неба», музеем-заповедником «Кижи». Реставрационные работы проводились Карельским научно-реставрационным управлением. Были заменены нижние венцы, кровли, отреставрированы главки, декор, оконные и дверные заполнения, восстановлена обшивка и конструкции тяблового «неба». В 1998 году кровли шатра колокольни обработали гидрофобизирующим составом из воска, живицы, скипидара и олифы. Благодаря реставрации церковь обрела облик, который имела в конце своей строительной истории.

На данный момент храм не действует. В Вегоруксах постоянных жителей не осталось, несколько домов используются как дачи. Архивные источники сообщают, что во второй половине XIX века в Вегоруксах было 39 дворов с населением 306 человек, а в начале ХХ века число дворов выросло до 48, а жителей, до 387 человек. Сейчас о существовавшем здесь большом селе напоминают лишь заброшенные старые дома и церковь, которая по-прежнему служит ориентиром.