Уже в 1580 году на острове существовали деревянные братские кельи и храм с двумя престолами: верхний был посвящен Пресвятой Троице, а нижний, Казанской иконе Божией Матери. В XVII веке был построен еще один храм в честь преподобного Михаила Малеина, покровителя первого русского царя из рода Романовых, Михаила Федоровича. Это посвящение было не случайным, так как князь Иван Борисович Черкасский, двоюродный брат царя, оказал значительную поддержку Романовым в период Смуты.

Каменное строительство в монастыре началось в конце XVII века при князе Михаиле Яковлевиче Черкасском. По благословению митрополита Нижегородского и Арзамасского Павла в 1688 году князь Михаил распорядился построить церковь с трапезной, кельи, переднюю стену с воротами, колокольню с церковью и ограду. В том же году были приглашены мастера из села Кадницы во главе с известным зодчим Павлом Сидоровичем Потехиным. Через несколько лет освятили каменную Казанскую церковь, затем надвратный храм в честь прп. Михаила Малеина, а позже был построен главный собор обители, Троицкий, в западном углу которого находилась гробница основателя монастыря иеросхимонаха Макария.

После революции монастырь постигла трагическая судьба. В конце 1920-х годов его закрыли, а здания использовали под жилье и мастерские. Затем началось разрушение архитектурного ансамбля: Троицкий собор, Казанский храм, стены монастыря и колокольня были уничтожены, а от храма Михаила Малеина и главного корпуса остались лишь руины. Когда остатки монастыря передали Церкви, сохранилась только одна башня.

Возрождение монастыря началось в 2007 году по благословению архиепископа, ныне митрополита, Нижегородского и Арзамасского Георгия. Владыка поручил монахине Иосифе Егасовой заниматься восстановлением обители, и работа на острове закипела. Первым насельницам помогали местные жители, администрация Павловского района и города Ворсмы, а также добровольцы. В 2010 году завершили восстановление колокольни, 28 июня заложили Троицкий собор, а 14 августа освятили престол церкви Михаила Малеина. 18 сентября 2011 года в возрожденном Троицком соборе прошла первая Божественная литургия, которую возглавил архиепископ Георгий в сослужении епископа Ставропольского и Невинномысского Кирилла. Затем состоялось перезахоронение останков основателя обители схимонаха Макария. В монастыре начали работы по восстановлению храма Казанской иконы Божией Матери.