В Ачитской крепости церковь была возведена в 1790 году. В самой ранней клировой ведомости, датированной 1838 годом, упоминается, что "усилиями прихожан была построена церковь". В ней было два престола: в честь Архангела Михаила и пророка Илии. Вокруг погоста находилась деревянная ограда, окрашенная краской. Здание церкви и колокольня были деревянными и крепкими, обшитыми тесом, с крышей, окрашенной в красный и местами белый цвет.

Штат церкви включал священника, дьякона и двух причетников. Предполагается, что первым священником был Алексей Серебренников, служивший до 1796 года, после чего он был переведен в Петро-Павловский храм Полевского завода. Служители получали жалованье от прихожан и хлебный сбор.

Новая каменная церковь была построена в 1863 году благодаря усилиям прихожан и церковнослужителей, при этом использовались церковные средства. В ведомости за 1916 год о церкви Михайлово-Архангельской в селе Ачит указано, что она была каменной, покрытой железом, с колокольней. В 1890 году церковь окружили каменной оградой с тремя железными воротами. В новой церкви было три престола: в честь Сретения Господня, Архистратига Божия Михаила и пророка Божия Илии.

Штат церкви состоял из священника, дьякона, псаломщика и просфорни. В 1916 году в Ачитский приход входили три населенных пункта: село Ачит с 537 дворами, деревня Нижний Выселок с 12 дворами и деревня Усть-Ут с 9 дворами.

Старожилы вспоминают, как в Ачите сбрасывали колокола и сжигали иконы, что вызывало слезы у местных жителей. Говорят, что те, кто участвовал в разрушении церкви, вскоре заболели и умерли или погибли при загадочных обстоятельствах.

Священнослужители также пострадали. Священник Павел Владимирович Лутков, оставшийся без прихода, был назначен в Беляевскую церковь в 1936 году, а в 1937 году арестован и расстрелян. Его жена, Лидия Васильевна, также была арестована и заключена на 10 лет.

Здание церкви подверглось капитальной перестройке: купол и колокольня были снесены, внутри появился второй этаж. На первом этаже был устроен кинозал, а на втором, сцена для драматического театра и библиотека. В 1972 году в Ачите построили новый Дом Культуры, и здание церкви стало использоваться для спортивного зала и районного Дома пионеров.

2 августа 1997 года состоялась первая после долгого перерыва божественная служба в церкви во имя Архистратига Михаила. Службы стали проводиться регулярно в небольшой части первого этажа. В 2006 году здание полностью вернули прихожанам, и настоятелем стал иерей Владимир Кисяков.

Благодаря усилиям отца Владимира церковь постепенно восстанавливается в своем первоначальном виде, хотя это оказалось непросто из-за отсутствия документации и фотографий. Восстановление идет на основе воспоминаний старожилов и нового архитектурного проекта. Уже убраны промежуточные стены и второй этаж, алтарь и клиросы заняли свои места. Церковь стала местом проведения служб и церковных таинств. Через Ачит проходят крестные ходы, и в 1999 году здесь был установлен поклонный крест в честь 2000-летия Рождества Христова.