Архангельская церковь была завершена и освящена в 1636 году. Это двухэтажное здание, в нижнем этаже которого находятся два придела: правый посвящен Архистратигу Михаилу, а левый, Всем Святым. Оба придела пострадали от пожара в январе 1860 года, но были восстановлены и вновь освящены 25 и 26 сентября того же года игуменом Вышенской пустыни Герасимом. На верхнем этаже церкви находится престол, посвященный Казанской иконе Божией Матери, который был освящен в 1863 году.