Каменная церковь, посвященная праведному Иоанну Кронштадтскому, была пристроена к восточной стороне келейного корпуса в 1997-1998 годах. Основой её необычной архитектурной композиции служит высокий кубический объем, на котором расположен приземистый восьмерик с шлемовидным куполом и декоративной главкой. С восточной стороны к храму примыкает полукруглая алтарная апсида, карнизы которой украшены кирпичным орнаментом. В архитектуре церкви использованы элементы модерна, что видно по углам четверика с рустованными лопатками и фасадам, выделяющимся треугольным фронтоном и рустованными пилястрами.

В настоящее время церковь Иоанна Кронштадтского функционирует.