Село Косинское когда-то принадлежало московским патриархам. В окладных книгах 1628 года патриаршего казённого приказа упоминается «церковь Иоанна Богослова в патриаршей отчине в селе Косинском», которая облагалась данью в размере 8 алтын и 2 денги, а также десятильничьей гривной. В 1669 году в приселке Косинском находилась церковь Иоанна Богослова, где проживали поп Иван Тимофеев с детьми и дьячок Овдокимко Федотов, а также насчитывалось 32 крестьянских двора и 3 бобыльских. Церковь в то время была деревянной. После упразднения патриаршества село перешло под управление синодального приказа.

В 1810 году благодаря стараниям дворянки Новокщёновой и прихожан была построена каменная церковь с колокольней и оградой. В ней было два престола: главный в честь Святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова и придельный тёплый во имя святых мучеников Адриана и Натальи.

К концу XIX века церковный причт состоял из священника и псаломщика. В 1889 году в селе открылась церковно-приходская школа, для которой построили отдельное здание. Усадьба в Косинском принадлежала городскому голове Николаю Алексеевичу Ганшину, и сохранилось её описание от 1910 года.

В советское время храм был закрыт и разорён, а колокольня и церковная ограда разрушены.