Первый храм, посвященный митрополиту Филиппу (Колычеву), который открыто выступил против террора Ивана Грозного, является не только данью памяти этому значимому духовному деятелю России, но и уникальным памятником архитектуры XVIII века.

В июле 1652 года мощи митрополита Филиппа были перевезены из Соловецкого монастыря, где он погиб, в Москву для общецерковного прославления в Успенском соборе. Процессией руководил митрополит Новгородский Никон, который в том же месяце стал патриархом. В Мещанской слободе мощи встретили крестным ходом с участием царя и духовенства. На этом месте сначала установили часовню с памятным крестом, а в 1677 году построили деревянную церковь в честь святителя Филиппа. В 1691 году ее заменили каменным зданием в стиле барокко, которое со временем обветшало. Митрополит Московский Платон разрешил возведение нового здания, и работы продолжались в 1777-1788 годах. Трапезная и колокольня сохранились с 1750-1752 годов.

Вопрос об архитекторе остается открытым, но наиболее вероятным автором проекта считают М.Ф. Казакова. Официально работами руководил С.А. Карин. Храм был построен в стиле классицизма и богато украшен. Барочная колокольня и почти лишенная декора трапезная контрастируют с ротондой основной части храма, украшенной наличниками, медальонами, ионическими портиками с лепниной и пилястровым портиком на алтарной апсиде. Ротонда завершается куполом с крупными окнами и фонарем, напоминающим парковую беседку. Похожее завершение Казаков использовал в церкви Вознесения Господня на Гороховом поле. Внутри церковь также впечатляет: в западной части ротонды расположены колонны ионического ордера, а в алтарной части, колонны коринфского ордера. Хоры поддерживаются колоннами дорического ордера. Архитектор стремился использовать все варианты классицистического декора, характерные для православных храмов того времени. Купол украшен изящными кессонами, а декоративные детали усиливают впечатление от масштабности интерьера.

Около 1939 года богослужения в храме прекратились. Окружающие здания и церковные дома были почти полностью снесены при строительстве спорткомплекса "Олимпийский". Однако сам храм сохранил не только внешний вид, но и почти полностью внутреннее убранство. В здании находился архив Госстандарта, что делало невозможным доступ к уникальным интерьерам. Ситуация изменилась в 1991 году, когда богослужения возобновились. В 1994 году при храме было создано Сибирское подворье, для которого построили часовню и два корпуса в стилистике Филипповского храма. Сегодня церковь открыта для всех желающих.