Церковь Бориса и Глеба известна как минимум с XVIII века. Рядом с ней до 1770 года находилась церковь Николо-Бортники, о чем упоминается в книге М. Миролюбова "Летопись села Заозерье". В двух километрах от деревни Деревеньки до сих пор стоит деревянная часовня святой великомученицы Варвары. Внутри часовни расположен колодец, который считается святым и целебным. У входа лежит камень с отпечатком стопы, предположительно принадлежащей святой Варваре. В её честь установлен местный праздник, который отмечается в девятую пятницу после Пасхи, сопровождаемый крестным ходом от церкви Бориса и Глеба. В начале XX века церковь была перестроена и в 1908 году состоялось её торжественное освящение. В строительстве активно участвовали жители деревни Юрьево, среди которых были зажиточные купцы, такие как Климовы и Барановы.

Церковь Бориса и Глеба является одной из немногих, уцелевших в советское время. В конце 1930-х годов была разобрана кладбищенская ограда и сняты колокола, а священник был арестован. Несмотря на это, прихожане смогли сохранить церковь, а староста спряталась с ключами в лесу. С началом Великой Отечественной войны отношение к религии смягчилось, и из заключения вернулся отец Павел Благовещенский, который служил в храме до своей смерти в 1963 году. Его могила находится у алтаря с северной стороны.

Хотя церковь и уцелела, она сильно пострадала от пожара, случившегося в ночь на Рождество 1987 года. Тогда от храма остались практически только стены, а шпиль с колокольни обрушился. Удалось спасти лишь часть икон и церковной утвари. В настоящее время храм почти восстановлен, но до прежнего величия ему еще далеко.