Одной из главных достопримечательностей Мстёры является сохранившийся до наших дней Богоявленский храм, построенный в 1687 году в период правления царицы Софьи. В это время русское войско под командованием князя В.В. Голицына совершало первый Крымский поход, а освобождённые от военной службы крепостные князей Ромодановских закладывали фундамент для каменного храма. Вероятно, за работой местных мастеров следил опытный зодчий, знакомый с архитектурой столицы. Он не следовал новым европейским веяниям, а опирался на традиции бесстолпных храмов середины XVII века, которые были близки народу. Возможно, князья Ромодановские хотели видеть в своей вотчине храм, напоминающий знаменитые московские церкви.

Строительство каменного храма в отдалённой Мстёре было значимым событием. Формы здания тщательно обсуждались, и, поскольку не было наглядных изображений, ориентировались на известные постройки. Среди образцов, которым должен был подражать зодчий, упоминались такие московские храмы, как церковь святой Троицы, Грузинской иконы Божией Матери и церковь Николы в Пыжах. После торжественной закладки начался сложный процесс строительства.

План будущей церкви был прост: к основному объёму примыкали с востока массивные алтарные апсиды, а с запада, трапезная. Завершение храма, которое придаст ему художественную завершённость, называлось "главы". Местные мастера стремились построить храм, который удивит всех, "каково не было прежде на Руси". По скрипящим лесам рабочие поднимали тяжёлые кирпичи и растворы. Самым ответственным моментом была кладка свода: стены наклонялись внутрь и смыкались к центру. На своде, отступая от края, устанавливался второй ряд кокошников, из которых вырастали пять главок. Огромная нагрузка ложилась на свод, поэтому центральная глава делалась глухой, чтобы избежать ослабления конструкции. Это было важно, так как в Благовещенской церкви в Вязниках, построенной за четыре года до этого, мастера не осмелились делать световые отверстия в своде. Местные каменодельцы, работавшие на том строительстве, хорошо это помнили.